Commit e1c35cfd authored by carlosribas's avatar carlosribas
Browse files

Initial updates to expert_databases.py

parent 7f37004f
...@@ -66,7 +66,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -66,7 +66,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '143', 'version': 'as of 7 June 2021',
}, },
{ {
'name': 'PDBe', 'name': 'PDBe',
...@@ -91,7 +91,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -91,7 +91,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': 'as of December 20th, 2020', 'version': 'as of 17 May 2021',
}, },
{ {
'name': 'FlyBase', 'name': 'FlyBase',
...@@ -116,7 +116,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -116,7 +116,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': 'FB2020_06', 'version': 'FB2021_03',
}, },
{ {
'name': 'Ensembl', 'name': 'Ensembl',
...@@ -147,7 +147,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -147,7 +147,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '102', 'version': '104',
}, },
{ {
'name': 'Ensembl Plants', 'name': 'Ensembl Plants',
...@@ -172,7 +172,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -172,7 +172,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '49', 'version': '51',
}, },
{ {
'name': 'Ensembl Fungi', 'name': 'Ensembl Fungi',
...@@ -197,7 +197,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -197,7 +197,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '49', 'version': '51',
}, },
{ {
'name': 'Ensembl Metazoa', 'name': 'Ensembl Metazoa',
...@@ -222,7 +222,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -222,7 +222,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '49', 'version': '51',
}, },
{ {
'name': 'Ensembl Protists', 'name': 'Ensembl Protists',
...@@ -247,7 +247,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -247,7 +247,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '49', 'version': '51',
}, },
{ {
'name': 'Ensembl/GENCODE', 'name': 'Ensembl/GENCODE',
...@@ -272,7 +272,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -272,7 +272,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': 'human 37/mouse M26', 'version': 'human 38/mouse M27',
}, },
{ {
'name': 'Rfam', 'name': 'Rfam',
...@@ -296,7 +296,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -296,7 +296,7 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': '',
'version': '14.2', 'version': '14.2',
}, },
{ {
...@@ -502,7 +502,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -502,7 +502,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '204', # ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/RELEASE_NUMBER 'version': '205', # ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/RELEASE_NUMBER
}, },
{ {
'name': 'RDP', 'name': 'RDP',
...@@ -583,7 +583,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -583,7 +583,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '', 'version': 'as of 17 May 2021',
}, },
{ {
'name': 'Greengenes', 'name': 'Greengenes',
...@@ -792,8 +792,8 @@ expert_dbs = [ ...@@ -792,8 +792,8 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': '', 'status': 'updated',
'version': '', 'version': 'as of 17 May 2021',
}, },
{ {
'name': 'RNApathwaysDB', 'name': 'RNApathwaysDB',
...@@ -832,7 +832,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -832,7 +832,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': 'r138', 'version': 'r138.1',
}, },
{ {
'name': 'SGD', 'name': 'SGD',
...@@ -856,8 +856,8 @@ expert_dbs = [ ...@@ -856,8 +856,8 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': '', 'status': 'updated',
'version': '', 'version': 'as of 27 April 2021',
}, },
{ {
'name': 'snOPY', 'name': 'snOPY',
...@@ -1219,7 +1219,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -1219,7 +1219,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '', 'version': '1.1',
}, },
{ {
'name': 'snoDB', 'name': 'snoDB',
...@@ -1293,8 +1293,8 @@ expert_dbs = [ ...@@ -1293,8 +1293,8 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': '', 'status': 'updated',
'version': '4.12', 'version': '5.2',
}, },
{ {
'name': 'GeneCards', 'name': 'GeneCards',
...@@ -1318,8 +1318,8 @@ expert_dbs = [ ...@@ -1318,8 +1318,8 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': '', 'status': 'updated',
'version': '4.14', 'version': '5.2',
}, },
{ {
'name': 'CRS', 'name': 'CRS',
...@@ -1342,7 +1342,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -1342,7 +1342,7 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': '',
'version': '2.1', 'version': '2.1',
}, },
{ {
...@@ -1367,8 +1367,8 @@ expert_dbs = [ ...@@ -1367,8 +1367,8 @@ expert_dbs = [
}, },
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': '', 'status': 'updated',
'version': '', 'version': 'as of 17 May 2021',
}, },
{ {
'name': 'ZFIN', 'name': 'ZFIN',
...@@ -1393,7 +1393,7 @@ expert_dbs = [ ...@@ -1393,7 +1393,7 @@ expert_dbs = [
], ],
'imported': True, 'imported': True,
'status': 'updated', 'status': 'updated',
'version': '', 'version': 'as of 22 April 2021',
}, },
{ {
'name': 'snoRNA Atlas', 'name': 'snoRNA Atlas',
......
Markdown is supported
0% or .
You are about to add 0 people to the discussion. Proceed with caution.
Finish editing this message first!
Please register or to comment