diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/alt_allele.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/alt_allele.sql
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index 0000000000000000000000000000000000000000..dc0dc034c4fd10fe8535b2acf7e75ed19a35ad10
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/alt_allele.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `alt_allele` (
+  `alt_allele_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `gene_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  UNIQUE KEY `gene_idx` (`gene_id`),
+  UNIQUE KEY `allele_idx` (`alt_allele_id`,`gene_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/alt_allele.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/alt_allele.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..042dc4c90e1426dc0f7037f38f7c8015ad5e610e
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/alt_allele.txt
@@ -0,0 +1,4 @@
+1	18256
+1	18257
+1	18258
+1	18259
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..6d46793d8e31f0f9d40dfaf38bb38c1e3ca19ee1
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis.sql
@@ -0,0 +1,20 @@
+CREATE TABLE `analysis` (
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `created` datetime NOT NULL default '0000-00-00 00:00:00',
+  `logic_name` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `db` varchar(120) collate latin1_bin default NULL,
+  `db_version` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  `db_file` varchar(120) collate latin1_bin default NULL,
+  `program` varchar(80) collate latin1_bin default NULL,
+  `program_version` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  `program_file` varchar(80) collate latin1_bin default NULL,
+  `parameters` varchar(255) collate latin1_bin default NULL,
+  `module` varchar(80) collate latin1_bin default NULL,
+  `module_version` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  `gff_source` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  `gff_feature` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`analysis_id`),
+  UNIQUE KEY `logic_name` (`logic_name`),
+  KEY `logic_name_idx` (`logic_name`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..33e134ad3128f232e0e2c06a47a2aa749aa31d65
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis.txt
@@ -0,0 +1,32 @@
+1	2000-09-08 16:10:03	RepeatMask	repbase	001212		RepeatMasker	1			RepeatMasker	1	RepeatMasker	repeat
+2	2000-09-22 10:59:05	Genscan	HumanIso.smat	1	HumanIso.smat	genscan	1.0			Genscan	1	genscan	prediction
+5	2000-09-28 17:33:27	Swall	swall	1	swall	wublastp	1		-hitdist=40, -cpus=1	BlastGenscanPep		wublastp	similarity
+7	2000-10-09 15:30:14	Vertrna	embl_vertrna	1	embl_vertrna	wutblastn	1		-hitdist=40, -cpus=1	BlastGenscanDNA	1	wutblastn	similarity
+4	2000-12-18 15:12:30	tRNAscan	tRNA	1		tRNAscan-SE	1.11			tRNAscan_SE	1	tRNAscan-SE	tRNA
+8	2000-12-18 18:28:03	CpG	cpg	1		cpg	1			CPG	1	cpg	cpg_island
+9	2001-01-15 17:00:00	Unigene	unigene.seq	1	unigene.seq	wutblastn	1		-hitdist=40, -cpus=1	BlastGenscanDNA	1	wutblastn	similarity
+10	2001-01-15 17:00:00	QTL		1			1			QtlPlacer	1	experimental	marker
+12	2001-03-28 16:42:32	dbEST	dbEST	1	dbEST	wutblastn	1		-hitdist=40, -cpus=1	BlastGenscanDNA	1	wutblastn	similarity
+6	2001-09-04 17:21:19	Eponine	NULL	NULL	NULL	eponine-scan	1	/usr/opt/java131/bin/java	-epojar => /usr/local/ensembl/lib/eponine-scan.jar, -threshold => 0.999	VC_EponineTSS	1	Eponine	TSS
+54	2002-08-12 14:52:26	human_swall_protein		1		TGE_gw	1			TargettedGeneWise		TGE_gw	gene
+53	2002-08-12 14:52:26	human_refseq_protein		1		TGE_gw	1			TargettedGeneWise		TGE_gw	gene
+1280	2002-08-12 14:52:26	other_swall_protein		1		similarity_genewise	1			FPC_BlastMiniGenewise		similarity_genewise	gene
+1281	2002-08-12 14:52:26	combined-protein_cdna		1		combined_gw_e2g	1			Combine_Genewises_and_E2Gs		combined_gw_e2g	gene
+1282	2002-08-12 14:52:26	ensembl		1		ensembl	1			Gene_Builder		ensembl	gene
+1290	2002-08-12 14:52:26	refseq_cdna	human_mRNA	1		exonerate_e2g	1			FilterESTs_and_E2G		exonerate	gene
+1291	2002-08-12 14:52:26	embl_vertrna	human_mRNA	1		exonerate_e2g	1			FilterESTs_and_E2G		exonerate	gene
+49	0000-00-00 00:00:00	Pfam	Pfam	1	/data/blastdb/Ensembl/Pfam_ls;/data/blastdb/Ensembl/Pfam_fs	/nfs/farm/Worms/bin/hmmpfam	1	/nfs/farm/Worms/bin/hmmpfam		Pfam	1	PFAM	domain
+40	0000-00-00 00:00:00	prints	prints	NULL	/acari/analysis/iprscan/data/prints.pval	/acari/analysis/iprscan/bin/OSF1/FingerPRINTScan	NULL	/acari/analysis/iprscan/bin/OSF1/FingerPRINTScan	NULL	Prints	NULL	PRINTS	domain
+41	0000-00-00 00:00:00	pfscan	pfscan	NULL	/acari/analysis/iprscan/data/prosite_prerelease.prf	/acari/analysis/iprscan/bin/OSF1/pfscan	NULL	/acari/analysis/iprscan/bin/OSF1/pfscan	NULL	Profile	NULL	PROFILE	domain
+43	0000-00-00 00:00:00	Signalp	signal_peptide	NULL	NULL	/usr/local/ensembl/bin/signalp	NULL	/usr/local/ensembl/bin/signalp	NULL	Signalp	NULL	Signalp	annot
+46	0000-00-00 00:00:00	tmhmm	transmembrane	NULL	NULL	/acari/work1/mongin/src/pipeline4anopheles/scripts/protein_pipeline/run_tmhmm	NULL	/acari/work1/mongin/src/pipeline4anopheles/scripts/protein_pipeline/run_tmhmm	NULL	Tmhmm	NULL	Tmhmm	annot
+45	0000-00-00 00:00:00	ncoils	coiled_coil	NULL	NULL	/usr/local/ensembl/bin/ncoils	NULL	/usr/local/ensembl/bin/ncoils	NULL	ncoils	NULL	ncoils	annot
+44	0000-00-00 00:00:00	Seg	low_complexity	NULL	NULL	/usr/local/ensembl/bin/seg	NULL	/usr/local/ensembl/bin/seg	NULL	Seg	NULL	Seg	annot
+42	0000-00-00 00:00:00	scanprosite	prosite	NULL	/acari/analysis/iprscan/data/prosite.patterns	/acari/analysis/iprscan/bin/scanregexpf.pl	/acari/analysis/iprscan/data/confirm.pat	/acari/analysis/iprscan/bin/scanregexpf.pl		Prosite	NULL	PROSITE	domain
+71	0000-00-00 00:00:00	Superfamily	Superfamily	1	/data/blastdb/Ensembl/sam/superfamily	/acari/work1/mongin/superfamily/superfamily.pl	1	/acari/work1/mongin/superfamily/superfamily.pl		Superfamily	1	Superfamily	annot
+1292	0000-00-00 00:00:00	SNPDensity	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+1293	0000-00-00 00:00:00	RepeatCoverage	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+1500	0000-00-00 00:00:00	miRanda	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+1501	0000-00-00 00:00:00	cisred	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+1502	0000-00-00 00:00:00	cisred_search	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+1503	0000-00-00 00:00:00	DitagAlign	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis_description.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis_description.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..0b6feef40b3b572ca03aca2c426a6bc9c203f885
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis_description.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `analysis_description` (
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `description` text collate latin1_bin,
+  `display_label` varchar(255) collate latin1_bin default NULL,
+  `displayable` BOOLEAN NOT NULL DEFAULT 1,
+  `web_data` TEXT,
+
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis_description.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis_description.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..d0aa3f5e48747dcd7c4cb332d94bc00b812a3891
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/analysis_description.txt
@@ -0,0 +1,3 @@
+1282	Genes were annotated by the Ensembl automatic analysis pipeline using either a GeneWise model from a human/vertebrate protein, a set of aligned human cDNAs followed by GenomeWise for ORF prediction or from Genscan exons supported by protein, cDNA and EST evidence. GeneWise models are further combined with available aligned cDNAs to annotate UTRs.	ensembl transcript 1 web data 1
+1503	new description	new label   0	    web data 2
+1504	updated description	\N  0	    web data 3
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..b83f7e7e2fc826aa13bb6222f6ffa46df43b918d
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly.sql
@@ -0,0 +1,13 @@
+CREATE TABLE `assembly` (
+  `asm_seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `cmp_seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `asm_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `asm_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `cmp_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `cmp_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `ori` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  KEY `cmp_seq_region_id` (`cmp_seq_region_id`),
+  KEY `asm_seq_region_id` (`asm_seq_region_id`,`asm_start`),
+  UNIQUE KEY all_idx (asm_seq_region_id, cmp_seq_region_id, asm_start, asm_end, cmp_start, cmp_end, ori)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..6c48f7a8717494c7ed7982ef7eb16ac80531552c
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly.txt
@@ -0,0 +1,43 @@
+469283	317101	30263615	30426490	101	162976	1
+469283	317332	30811187	30929959	101	118873	1
+469283	317348	31086734	31205532	101	118899	1
+469283	317523	30451401	30562994	101	111694	1
+469283	318770	30726577	30811186	101	84710	1
+469283	319047	30562995	30708200	101	145306	1
+469283	319456	30993469	31086733	101	93365	1
+469283	339816	30426491	30451400	101	25010	1
+469283	345105	30708201	30726576	1	18376	1
+469283	368744	30249935	30263614	101	13780	1
+469283	376992	31205533	31254640	101	49208	1
+469283	469270	30929960	30993468	101	63609	1
+469341	376992	1	49208	1	49208	1
+469339	318770	1	84710	1	84710	1
+469336	345105	1	18376	1	18376	1
+469335	319456	1	93365	1	93365	1
+469343	469270	1	63609	1	63609	1
+469333	317523	1	111694	1	111694	1
+469340	339816	1	25010	1	25010	1
+469342	319047	1	145414	1	145414	1
+469338	368744	1	13780	1	13780	1
+469332	317348	1	118899	1	118899	1
+469334	317101	1	162976	1	162976	1
+469337	317332	1	118873	1	118873	1
+469348	368744	657970	671649	101	13780	1
+469348	317101	671650	834525	101	162976	1
+469348	339816	834526	859435	101	25010	1
+469348	317523	859436	971029	101	111694	1
+469348	319047	971030	1116235	101	145306	1
+469348	345105	1116236	1134611	1	18376	1
+469348	318770	1134612	1219221	101	84710	1
+469348	317332	1219222	1337994	101	118873	1
+469348	469270	1337995	1401503	101	63609	1
+469348	319456	1401504	1494768	101	93365	1
+469348	317348	1494769	1613567	101	118899	1
+469348	376992	1613568	1662675	101	49208	1
+965899	965888	1	16571	1	16571	1
+469271	965905	1	200	10	209	1
+469271	965905	201	400	401	600	-1
+469282	965905	1	100	701	800	-1
+965906	469283	563	3444	31222465	31225346	1
+965906	469283	397	562	31214121	31214286	1
+965906	469283	100	396	31210077	31210373	1
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly_exception.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly_exception.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..4b0fb1663a707a58b91626331084b3775209bbb8
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly_exception.sql
@@ -0,0 +1,15 @@
+CREATE TABLE `assembly_exception` (
+  `assembly_exception_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `exc_type` enum('HAP','PAR') collate latin1_bin NOT NULL default 'HAP',
+  `exc_seq_region_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `exc_seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `exc_seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `ori` int(11) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`assembly_exception_id`),
+  KEY `sr_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `ex_idx` (`exc_seq_region_id`,`exc_seq_region_start`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly_exception.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly_exception.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..50b1fec58bce684b813f842ef43f86f6f3531375
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/assembly_exception.txt
@@ -0,0 +1,2 @@
+1	469294	10000000	10500000	PAR	469283	30300000	30800000	1
+2	469351	30500000	30599999	HAP	469283	30500000	30699999	1
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/attrib_type.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/attrib_type.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..f6bd742d6c60f20ef39abb2694f76e71d3186d44
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/attrib_type.sql
@@ -0,0 +1,9 @@
+CREATE TABLE `attrib_type` (
+  `attrib_type_id` smallint(5) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `code` varchar(15) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `name` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `description` text collate latin1_bin,
+  PRIMARY KEY  (`attrib_type_id`),
+  UNIQUE KEY `c` (`code`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/attrib_type.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/attrib_type.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..e23310e01738ae2d32b337100f650c963a14e1a0
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/attrib_type.txt
@@ -0,0 +1,17 @@
+1	synonym	Alternate names for clone	Synonyms
+2	FISHmap	FISH information	FISH map
+3	organisation	Organisation sequencing clone	
+4	state	Current state of clone	
+5	BACend_flag	BAC end flags	
+6	embl_acc	EMBL accession number	
+7	superctg	Super contig id.	
+8	seq_len	Accession length	
+9	fp_size	FP size	
+10	note	Note	
+11	positioned_by	Positioned by	
+12	bac_acc	BAC end accession	
+13	htg_phase	HTG Phase	High Throughput Genome Phase
+14	toplevel	Top Level	Top Level Non-Redundant Sequence Region
+15	_rna_edit	RNA editing	\N
+16	_selenocysteine	Selenocysteine	\N
+17	codon_table	Codon Table	Alternate codon table
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/coord_system.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/coord_system.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..28c98fed88587976af81f33c747a17d41da27c43
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/coord_system.sql
@@ -0,0 +1,11 @@
+CREATE TABLE `coord_system` (
+  `coord_system_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `name` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `version` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  `rank` int(11) NOT NULL default '0',
+  `attrib` set('default_version','sequence_level') collate latin1_bin default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`coord_system_id`),
+  UNIQUE KEY `rank` (`rank`),
+  UNIQUE KEY `name` (`name`,`version`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/coord_system.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/coord_system.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..0a9b27b9b9b28fd76ffeb39f4eeb9a0dc8a93290
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/coord_system.txt
@@ -0,0 +1,6 @@
+1	chromosome	NCBI33	1	default_version
+2	supercontig	\N	2	default_version
+3	clone	\N	3	default_version
+4	contig	\N	4	default_version,sequence_level
+6	chunk	\N	5	default_version
+7	alt_chrom	\N	6	default_version
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_feature.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_feature.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..d26f19e3df236ca879e446041be2097a46bab58d
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_feature.sql
@@ -0,0 +1,12 @@
+CREATE TABLE `density_feature` (
+  `density_feature_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `density_type_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `density_value` float NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`density_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`density_type_id`,`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `seq_region_id_idx` (`seq_region_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..bd5a82cdf4e535051e1eec476209cd02311aa0ed
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_feature.txt
@@ -0,0 +1,12 @@
+1	1	469283	1	100	50.3
+2	1	469283	101	200	68.8
+3	1	469283	201	300	32
+4	1	469283	301	400	90.9
+5	1	469283	401	500	88.8
+6	1	469283	501	600	12
+7	2	469283	1	100	50.3
+8	2	469283	101	200	68.8
+9	2	469283	201	300	32
+10	2	469283	301	400	90.9
+11	2	469283	401	500	88.8
+12	2	469283	501	600	12
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_type.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_type.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..b0349341fbd65e7e0233cb8207c75da56939aeec
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_type.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `density_type` (
+  `density_type_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `analysis_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `block_size` int(11) NOT NULL default '0',
+  `region_features` int(11) NOT NULL default '0',
+  `value_type` enum('sum','ratio') collate latin1_bin NOT NULL default 'sum',
+  PRIMARY KEY  (`density_type_id`),
+  UNIQUE KEY `analysis_id` (`analysis_id`,`block_size`,`region_features`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_type.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_type.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..7d3b2db1e172cb1146ff149a5eeb51d76fcc7b77
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/density_type.txt
@@ -0,0 +1,2 @@
+1	1292	100	0	sum
+2	1293	100	0	ratio
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..ba40f85055c960928968e28e06d64f6d508bc699
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE ditag (
+
+       ditag_id INT(10) NOT NULL auto_increment,
+       name VARCHAR(30),
+       type VARCHAR(30),
+       tag_count smallint(6) default 1,
+       sequence TEXT,
+
+       PRIMARY KEY ( ditag_id )
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..6c62400734358eadb133aae09c5c62ebd9ecd481
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag.txt
@@ -0,0 +1,20 @@
+3278356	162B08-6	ZZ13	1	GAAGCAAAACACTACAATGGCGGTGCGCTCGACGCGCC
+3278355	198K08-11	ZZ13	1	TTTGATAATTTATTTCAGGCTCTGCGAGAATGAACTC
+3278354	137M14-9	ZZ13	1	GCCTGTTAGATTCACCCCGGTCTCGAGTCTCTCTCTC
+3278353	201K11-2	ZZ13	1	CCTTGAAATTAAGAAGAAGGGCTCGCCGCCGCCGCAC
+3278352	151H04-2	ZZ13	1	GTTCAGTATGGTTTTCAAGAGGGTTAATTGAAAGAG
+3278351	119K09-6	ZZ13	2	TGGAATCTCCATTATTATGAGCGCGCCGCCCCACTCC
+3278350	187N08-1	ZZ13	1	GGAGGTGGATGAGAGGCCAACTCCAGCTCTCTCTCT
+3278349	211G12-2	ZZ13	1	GGGCTGCGATTGCAGCTCACCCTTCGTTAGATAATCA
+3278348	181D04-4	ZZ13	4	TTCTTTCTTTTTTAAAGGGGGTCACGGTCGCCAAACC
+3278347	213E17-4	ZZ13	1	ACATGGGAGACATTTTGCCAAGGCAGCATCAAAAAAC
+3278346	112H10-9	ZZ13	2	AGAGAGAGCTGGAGTTTTGGTAAGAGCATCCTAAGC
+3278345	229D11-1	ZZ13	1	GGCTGGGATAGAGGAGGACGTCTCGAGTCTCTCTCTC
+3278344	235I06-3	ZZ13	1	CGAGAAAAGGAGAGGAGCCTGCTGCCTCCGCCAGAC
+3278343	191F14-10	ZZ13	1	TCCAGCTGCATGAGCAAGGGCCGGGGGCGCGTCAGACC
+3278342	188P19-10	ZZ13	2	ATGGTTATGAGCTGCTCTGCGAGCGCGCGAGTGAGCA
+3278341	224L18-4	ZZ13	1	GTGGCTCCAGGCATCCAGCATAAAATACATGTCTCAA
+3278340	156G19-5	ZZ13	3	GAGAGAGCTGGAGTTTTTACGGAAGCTGCTGCCGCCC
+3278339	189F08-4	ZZ13	1	CACGGCAATTCCTAGGTCCCGAGCGGAATAACAGGCCC
+3278338	134O12-6	ZZ13	1	GGAGACTGCTGGGAGTCCTAAACTCCAGCTCTCTCTCT
+3278337	219H13-10	ZZ13	1	TGCAGCCGCCCATCAAGAATGGGCTCTGGAGGCAGACC
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag_feature.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag_feature.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..111e7e03c5c844cc95c30be3481d07d102b291a3
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag_feature.sql
@@ -0,0 +1,20 @@
+CREATE TABLE ditag_feature (
+
+       ditag_feature_id int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+       ditag_id int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       ditag_pair_id int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       seq_region_id int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       seq_region_start int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       seq_region_end int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       seq_region_strand tinyint(1) NOT NULL default '0',
+       analysis_id int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       hit_start int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       hit_end int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+       hit_strand tinyint(1) NOT NULL default '0',
+       cigar_line text default '',
+       ditag_side char default '',
+
+       PRIMARY KEY  (ditag_feature_id),
+       KEY (ditag_id),
+       KEY (ditag_pair_id)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..4c1f7d3abf47aa496d73baa4813e72f412e8528f
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/ditag_feature.txt
@@ -0,0 +1,18 @@
+4828567	3278337	1	469273	120635196	120635214	1	1503	1	19	1	19M	L
+4828568	3278337	1	469273	120640125	120640142	1	1503	20	37	1	18M	R
+4828699	3278342	1	469288	78423526	78423543	1	1503	1	18	1	18M	L
+4828700	3278342	1	469288	78482803	78482821	1	1503	19	37	1	19M	R
+4828469	3278343	1	469271	75028243	75028261	-1	1503	1	19	1	19M	L
+4828470	3278343	1	469271	75026001	75026018	-1	1503	20	37	1	18M	R
+4828725	3278346	1	469273	98254679	98254696	1	1503	1	18	1	18M	L
+4828726	3278346	1	469273	97923747	97923763	1	1503	20	36	1	17M	R
+4828557	3278347	1	469275	100525017	100525035	-1	1503	1	19	1	19M	L
+4828558	3278347	1	469275	100522073	100522091	-1	1503	19	37	1	19M	R
+4828761	3278348	1	469288	111529629	111529647	-1	1503	1	19	1	19M	L
+4828762	3278348	1	469288	111528958	111528976	-1	1503	19	37	1	19M	R
+4828459	3278351	1	469273	83236330	83236347	-1	1503	1	18	1	18M	L
+4828460	3278351	1	469273	83225874	83225891	-1	1503	19	36	1	18M	R
+4828401	3278355	1	469275	24825423	24825440	1	1503	1	18	1	18M	L
+4828402	3278355	1	469275	24838796	24838814	1	1503	19	37	1	19M	R
+4828583	3278356	1	469272	40626355	40626373	-1	1503	1	19	1	19M	L
+4828584	3278356	1	469272	40572274	40572291	-1	1503	20	37	1	18M	R
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..0a518b9e7bd455e74712b346b199c9c6890814f8
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna.sql
@@ -0,0 +1,6 @@
+CREATE TABLE `dna` (
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `sequence` mediumtext collate latin1_bin NOT NULL,
+  PRIMARY KEY  (`seq_region_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=750000 AVG_ROW_LENGTH=19000;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..3640c09fc259a758a0827f9818432cf07636891c
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna.txt
@@ -0,0 +1,13 @@
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+345105	AGGCAGATGCAGAGATGGAGACATGAGACTCAGTGCAGTGGGCAGGGAAGACATAACAGATGGAAGCAAAGGAATCCTGCCTGCCTTCAGCAGAGAATTCACCGAATCCTAGAACTGTGGCTCCCTCCAGGCAGAGCCTAAGATGCTGGTGAAGAATAGCTGTGTGATTGAATAGGCTCAAAGGAGAGTTCAGAATTCCCATTTACATATTACTAGTTTGGTTTGTAAGTTTTAGTTCCTTGTATTATTGAGATTCAGAGCTTCATTTTATGTTGGTCATTAGGTGAATATTACTCATTTTCCCTCAAGAGAAGCTCATAAGTGTGTGTGGGTGTGAGAGCACGATGGTGCCTGTGTTCTGTGAATGTGTCCATATGTGTCTGTAAGAGAGACAGAGACCAAGAACTTGCCCAATTTTAGAAATACACTAATGTGCAGTTGTTGCCTTTTGTCTGTATTGAAGGCCCATTGAATGACTAATCCAGGCTGGAAGCATTCCCATGTGGGTGTCTGAGTCCATGAGCCAAGCCTGAGGGGACAGTGAGTCTCCAGGTCTGCCACACTGGTGCACCTTGCTGGCACGGTGCCTCAGGAAGGTGGCGACTCAGGTGGGCCTTGAGTTATATTTTAACTCAGCTGCTCAGTTCCCAGGGCACATTTCTGGATCAGAACCCATGGGAAACAGGAGGTACTAAGTGCAATGTCTTAGCATTCTGCAAAATGGAGATCTGTTGTCCAGCGGCTTATCTCCTTTTTAGTAACCCTTCTTTCTGAACCCAGGGCCCTTTTCAGCCTTCCCTCATATTTTCTTGAGATCAAACTTTACTTCTTTCTTATTTACTAAGAATTTGCCTGTTTGAATAAGAACAAAACGCTAAGGTGGGTAGCCTAAGCTGATTTTCTGCTGGTTACACGTGTCTCTCACACCACATTTCCTCAAAGCTAATCTGAATTCTGTAGGCTAAAAATATTCATGTAGCAAATCTGAGAATTGAAAACTGCAGATAACCGGCCGGGTATGGTGACTCATGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGACCACCTGAGGTTAGGACTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTGTACTAAAAATACAAAAATTTGCCTGGTGTGGTGGTGCATGCCTCTAGTCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCACGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATAACACTACTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCCCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAGAAAGAAAAAGAAAACTGCAGATAACCCTATACATTAATACTGGTATCTCGAGGTGACTCTTCTGACCAAGGGTGGTTAAGTGACACATAGAACTTTTCTAAGAGAAGACAGACAAGTTGACAGGCATGCCTTGTACTCAGCTGTGTTCATGTGGTGGTCTGTGGAAAGAAAAGAAGACTCATTTGGAAATGAAGCTGTCCCTTTCCAAGCAGTCTCTGGTGCTTTTCTTCTCTCAAAATGGATCCGATAAATATTTGAATAGAGCAGATTGTAGAATGTCGTGCTGTCACCAGAAAGCTGCTGTTTTGGGTTCTGCATTGAGCCAAATATGTAGAGGACCTACCAAGCCCACTGAGGGACTAGGTTTTCATGTCTCTAGTCATACCTAGAATGTTCTGAGCCGTCTGAGGGCCTTCATGCCGGCAGCAGCTAGCAAAGCCAGAAAGCAAGTCTAACAGGATCTAAGATGACCATCAGGAGAAGGAGTTTGAGACTGTGTATGCAACCCCCAATAGACCCCCTTTTACTCTGATCTGGAGAATGTATCTGGCTTCATATTTTCAAGTCACATGTCTCTCAGACCCCTGGATTCAGAACCCAAGGCCACAAATCATAGGCATGAAGCACTTTCTTAAGACTGACCTAACGCTGGATTATTTCCCGTCCAATGCCTGCATGCTGCTTGAATTGCTCCACCCACACCTCCATGACCAAGGGCGCCAGAGTGCTGCAACTGGGGCGTGGGCCGCTCTCTGCTTTTCCTGTCTGACTCTGACAAGTCCTCCCTCACTGAATGTAGAATCGTTGCCAAGTTTCTGAGAAGTGTCGATTCCCTGTTAACATGGATATCAGTTCTGCCTCACATTTCCCACTTGAGGTTGAGGCGTACTGGAGACAACACCTCAGACCATCTGAACCCCATCAGTGGACGAAAATGGGGCTGTTAATATACTCTAAAAGCCATACTAAAAATGCTCTGAGGGAACTGGCTAAGAATAGTGGGCCTGGTGATTGTCTATCACGCAAGGCTTTGTTTTGTACTGTTCAGAAATCTGTCACCTTTCTGCCTGCCCTTGTTTCCTGAATGAAATGCTTCTGGGGTTATTTATGAAAGGAGTGATCCTGGGGCAGGCAGGAGGCAGTGGGCTTCATGGCTCCTTGAAGTTATTACTGATCTTGACCTTCTCTTTGGCTACCTTTAGACAAAGAATACGCCAATCAATACTTGGGGCTCTAAGTTTTACAATTGATATTTATTTGTATCATCTCTTTGTCTAGGAATGTAAAAGTGATTCTAAACTAAGATGTGTAATAAAAATCAATCAGATTTATTGTACCTACAAAAAGGTGTCCTCATAAATGACTAAGGCTTTTGAAAATGACATGCCTGTGGCTGACACACTGCCATTTTCAATAAACATTTTAACTGGGTGGGAGTGGGAAAATGAAGATTGAGTTGGGATGCTGGCATTATTTAATATAGCAACAAGGGGCAGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGCCGGGTGGATCACTTCAGGTCAGGAGTTGGAGACGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAATTGAGTCGGGCGTGGTGGTGCGCACCTGTCATCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAGGCCGAGATTGCAGTAGGCCAAGATTGCACAACTGCACTTCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCCGCCTCAAAAATAAATAAGTAAATAAAAATAAATAAATAATGTAGCAACAAGGAAAAGGACACAAAATGAAGAATGATAGAGTGACAAATAAGTGTTTTTCATGTTTTTCCGTGGAGGTTCCTGAGACTGGCCTGGGCAACGGCATGAAATTTCTTTTAACTTTTGTGTTTTGTTTTAAAAATTCTTTTAAATTTACTATTATACATCATACTTTAAAATATATGTGCCTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGCATCATTCTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTGATCACGGTTCTCTGCAGCCTCAGCCTCACAGGCTAGTGATCTTCCCACCTCAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTATACCTGGCTAATTTTTTATTTTTTGTAGAAATGGGGTCTCTCTATGTTGCCCAGGCTGATCTGTGCCTTTTTTAACACTAAAGTATTTTATGTTGTTTACCATCAGGAAAAGAAGATACAAAAAATGGGCCACACATTGTCTTTTGGATTTCCATGCTCGTAGGCCTGCTGGAGTGACCCTGGGGGGTTGTGCCCCTTAGTTGAGAAGTGGGACTGGGTGGAAGGAGCACAGACCCTGGATTCCAAGCTGGGTTTGAATTCTAGTATTGCCACCACTTACTAGCCATATGACTAGGAGGAATTTAATTGACCTCTCTGAACTTTGGGGCCTTTGTCTGTAAAGTGGAGTGATTATCCCCACTTTGAAGGGCCATTTTGAGGATCAGCGATACATTTAAAGCAGCAAGTACAGTATGGGATAGAGCAAACGTGAAAAAAATGTGGTTATTGCTGTGATAAGGCACTGTGTTTAGAAGACACCATGAACACTTTGTGTCCCGAGAAACTAGAAGTCAGTATTGGACATACCATCTTTAGAAAATCCTAAAGAAAAGCTGTTAACTGTTTAGTAATGTGTATTGAGTACCTACTATGTGTCAAGCTGTTCTAGGCACTAGATATATAGACGTAACACCAGGAACCTGCCTACATGGAACTTGCACTTTAATGGGGATGGAGGATGGGTAAATGTTAAATTAACCAAATGCACACAAATATATGATTATGAATTGTGTCAAATGTCATGAAGTTATAATAGGTTTTTGTTTTTATTTTTGTTTTGAGACGAGCTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTACAGTGAGTGGCGTGATCATAGCTCACTGTAGCCTCGACCTCCTGGGCTCAAACGATCCTCCTGCCTCAGTCCCCCAAGTAACGGACCAAGGTGCGAACCACCATGGCTGACTAATTTTTTAAAATTTTTTATAGAGATAGGATTTTGTCATTTTGCCCAGGATGGTCTTGAACTTATGGGCTCAAGTGATGCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGAATTATATGTGTGAGCCACCCTGTGTGGCCAATATAATAGAATATTATAAAAGGAGAGTGGAGACCTAATTTAGATGGGGTGGGTAAAGTAGGAAAGGGCTCTTTGAAGAAATGACAGTTACAGTGAGATCTAGAGGACAGGAGTTAGCTGGGCAAGGAGGAGGGAAGGGCATTTGTGAAGGGATGGGGGAACAGTGTTTGCGAGGGTTTTGCAGAACAAACTCAAATTTCACAAGAAGGTATCTGCAGTCCCTTTTTACCCTCACTAGAGGGTAGCATGGAGAACTGTAGAAAAGATTACAGTCTAGGACTTTAAAGATAGCAACAAAAAATGTAAAGAGCACAAAGGGGACAGTGGCCTGTGCGACTCGGGCAAACGTTTCATAATTGTGTTTCTTCATAAGACGCTTTCAAACTATGTGTAATGTCTGTTTACTCCCCACCCTTCCAAAAAGAGTTAAGAAACAGCTTGGCTTAGCCTCAGTAATTACTAGTTTAGAATAGTTC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CTCTTTTAGTATAAATAGTACCGTTAACTTCCAATTAACTAGTTTTGACAACATTCAAAAAAGAGTAATAAACTTCGCCTTAATTTTAATAATCAACACCCTCCTAGCCTTACTACTAATAATTATTACATTTTGACTACCACAACTCAACGGCTACATAGAAAAATCCACCCCTTACGAGTGCGGCTTCGACCCTATATCCCCCGCCCGCGTCCCTTTCTCCATAAAATTCTTCTTAGTAGCTATTACCTTCTTATTATTTGATCTAGAAATTGCCCTCCTTTTACCCCTACCATGAGCCCTACAAACAACTAACCTGCCACTAATAGTTATGTCATCCCTCTTATTAATCATCATCCTAGCCCTAAGTCTGGCCTATGAGTGACTACAAAAAGGATTAGACTGAGCCGAATTGGTATATAGTTTAAACAAAACGAATGATTTCGACTCATTAAATTATGATAATCATATTTACCAAATGCCCCTCATTTACATAAATATTATACTAGCATTTACCATCTCACTTCTAGGAATACTAGTATATCGCTCACACCTCATATCCTCCCTACTATGCCTAGAAGGAATAATACTATCGCTGTTCATTATAGCTACTCTCATAACCCTCAACACCCACTCCCTCTTAGCCAATATTGTGCCTATTGCCATACTAGTCTTTGCCGCCTGCGAAGCAGCGGTGGGCCTAGCCCTACTAGTCTCAATCTCCAACACATATGGCCTAGACTACGTACATAACCTAAACCTACTCCAATGCTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAGCACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCCTAATTATTAGCATCATCCCCCTACTATTTTTTAACCAAATCAACAACAACCTATTTAGCTGTTCCCCAACCTTTTCCTCCGACCCCCTAACAACCCCCCTCCTAATACTAACTACCTGACTCCTACCCCTCACAATCATGGCAAGCCAACGCCACTTATCCAGCGAACCACTATCACGAAAAAAACTCTACCTCTCTATACTAATCTCCCTACAAATCTCCTTAATTATAACATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCACTGCCCAAGAACTATCAAACTCCTGAGCCAACAACTTAATATGACTAGCTTACACAATAGCTTTTATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCCTTGTACTATCCCTATGAGGCATAATTATAACAAGCTCCATCTGCCTACGACAAACAGACCTAAAATCGCTCATTGCATACTCTTCAATCAGCCACATAGCCCTCGTAGTAACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTCACATCCTCATTACTATTCTGCCTAGCAAACTCAAACTACGAACGCACTCACAGTCGCATCATAATCCTCTCTCAAGGACTTCAAACTCTACTCCCACTAATAGCTTTTTGATGACTTCTAGCAAGCCTCGCTAACCTCGCCTTACCCCCCACTATTAACCTACTGGGAGAACTCTCTGTGCTAGTAACCACGTTCTCCTGATCAAATATCACTCTCCTACTTACAGGACTCAACATACTAGTCACAGCCCTATACTCCCTCTACATATTTACCACAACACAATGGGGCTCACTCACCCACCACATTAACAACATAAAACCCTCATTCACACGAGAAAACACCCTCATGTTCATACACCTATCCCCCATTCTCCTCCTATCCCTCAACCCCGACATCATTACCGGGTTTTCCTCTTGTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTTACGACCCCTTATTTACCGAGAAAGCTCACAAGAACTGCTAACTCATGCCCCCATGTCTAACAACATGGCTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAACCATGCACACTACTATAACCACCCTAACCCTGACTTCCCTAATTCCCCCCATCCTTACCACCCTCGTTAACCCTAACAAAAAAAACTCATACCCCCATTATGTAAAATCCATTGTCGCATCCACCTTTATTATCAGTCTCTTCCCCACAACAATATTCATGTGCCTAGACCAAGAAGTTATTATCTCGAACTGACACTGAGCCACAACCCAAACAACCCAGCTCTCCCTAAGCTTCAAACTAGACTACTTCTCCATAATATTCATCCCTGTAGCATTGTTCGTTACATGGTCCATCATAGAATTCTCACTGTGATATATAAACTCAGACCCAAACATTAATCAGTTCTTCAAATATCTACTCATTTTCCTAATTACCATACTAATCTTAGTTACCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAGTCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGAGACCCACAACAAATAGCCCTTCTAAACGCTAATCCAAGCCTCACCCCACTACTAGGCCTCCTCCTAGCAGCAGCAGGCAAATCAGCCCAATTAGGTCTCCACCCCTGACTCCCCTCAGCCATAGAAGGCCCCACCCCAGTCTCAGCCCTACTCCACTCAAGCACTATAGTTGTAGCAGGAATCTTCTTACTCATCCGCTTCCACCCCCTAGCAGAAAATAGCCCACTAATCCAAACTCTAACACTATGCTTAGGCGCTATCACCACTCTGTTCGCAGCAGTCTGCGCCCTTACACAAAATGACATCAAAAAAATCGTAGCCTTCTCCACTTCAAGTCAACTAGGACTCATAATAGTTACAATCGGCATCAACCAACCACACCTAGCATTCCTGCACATCTGTACCCACGCCTTCTTCAAAGCCATACTATTTATGTGCTCCGGGTCCATCATCCACAACCTTAACAATGAACAAGATATTCGAAAAATAGGAGGACTACTCAAAACCATACCTCTCACTTCAACCTCCCTCACCATTGGCAGCCTAGCATTAGCAGGAATACCTTTCCTCACAGGTTTCTACTCCAAAGACCACATCATCGAAACCGCAAACATATCATACACAAACGCCTGAGCCCTATCTATTACTCTCATCGCTACCTCCCTGACAAGCGCCTATAGCACTCGAATAATTCTTCTCACCCTAACAGGTCAACCTCGCTTCCCCACCCTTACTAACATTAACGAAAATAACCCCACCCTACTAAACCCCATTAAACGCCTGGCAGCCGGAAGCCTATTCGCAGGATTTCTCATTACTAACAACATTTCCCCCGCATCCCCCTTCCAAACAACAATCCCCCTCTACCTAAAACTCACAGCCCTCGCTGTCACTTTCCTAGGACTTCTAACAGCCCTAGACCTCAACTACCTAACCAACAAACTTAAAATAAAATCCCCACTATGCACATTTTATTTCTCCAACATACTCGGATTCTACCCTAGCATCACACACCGCACAATCCCCTATCTAGGCCTTCTTACGAGCCAAAACCTGCCCCTACTCCTCCTAGACCTAACCTGACTAGAAAAGCTATTACCTAAAACAATTTCACAGCACCAAATCTCCACCTCCATCATCACCTCAACCCAAAAAGGCATAATTAAACTTTACTTCCTCTCTTTCTTCTTCCCACTCATCCTAACCCTACTCCTAATCACATAACCTATTCCCCCGAGCAATCTCAATTACAATATATACACCAACAAACAATGTTCAACCAGTAACCACTACTAATCAACGCCCATAATCATACAAAGCCCCCGCACCAATAGGATCCTCCCGAATCAACCCTGACCCCTCTCCTTCATAAATTATTCAGCTTCCTACACTATTAAAGTTTACCACAACCACCACCCCATCATACTCTTTCACCCACAGCACCAATCCTACCTCCATCGCTAACCCCACTAAAACACTCACCAAGACCTCAACCCCTGACCCCCATGCCTCAGGATACTCCTCAATAGCCATCGCTGTAGTATATCCAAAGACAACCATCATTCCCCCTAAATAAATTAAAAAAACTATTAAACCCATATAACCTCCCCCAAAATTCAGAATAATAACACACCCGACCACACCGCTAACAATCAGTACTAAACCCCCATAAATAGGAGAAGGCTTAGAAGAAAACCCCACAAACCCCATTACTAAACCCACACTCAACAGAAACAAAGCATACATCATTATTCTCGCACGGACTACAACCACGACCAATGATATGAAAAACCATCGTTGTATTTCAACTACAAGAACACCAATGACCCCAATACGCAAAATTAACCCCCTAATAAAATTAATTAACCACTCATTCATCGACCTCCCCACCCCATCCAACATCTCCGCATGATGAAACTTCGGCTCACTCCTTGGCGCCTGCCTGATCCTCCAAATCACCACAGGACTATTCCTAGCCATACACTACTCACCAGACGCCTCAACCGCCTTTTCATCAATCGCCCACATCACTCGAGACGTAAATTATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGTAGACAGTCCCACCCTCACACGATTCTTTACCTTTCACTTCATCTTACCCTTCATTATTGCAGCCCTAGCAGCACTCCACCTCCTATTCTTGCACGAAACGGGATCAAACAACCCCCTAGGAATCACCTCCCATTCCGATAAAATCACCTTCCACCCTTACTACACAATCAAAGACGCCCTCGGCTTACTTCTCTTCCTTCTCTCCTTAATGACATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCCCGAATGATATTTCCTATTCGCCTACACAATTCTCCGATCCGTCCCTAACAAACTAGGAGGCGTCCTTGCCCTATTACTATCCATCCTCATCCTAGCAATAATCCCCATCCTCCATATATCCAAACAACAAAGCATAATATTTCGCCCACTAAGCCAATCACTTTATTGACTCCTAGCCGCAGACCTCCTCATTCTAACCTGAATCGGAGGACAACCAGTAAGCTACCCTTTTACCATCATTGGACAAGTAGCATCCGTACTATACTTCACAACAATCCTAATCCTAATACCAACTATCTCCCTAATTGAAAACAAAATACTCAAATGGGCCTGTCCTTGTAGTATAAACTAATACACCAGTCTTGTAAACCGGAGACGAAAACCTTTTTCCAAGGACAAATCAGAGAAAAAGTCTTTAACTCCACCATTAGCACCCAAAGCTAAGATTCTAATTTAAACTATTCTCTGTTCTTTCATGGGGAAGCAGATTTGGGTACCACCCAAGTATTGACTCACCCATCAACAACCGCTATGTATTTCGTACATTACTGCCAGCCACCATGAATATTGTACGGTACCATAAATACTTGACCACCTGTAGTACATAAAAACCCAACCCACATCAAACCCCCCCCCCCCATGCTTACAAGCAAGTACAGCAATCAACCTTCAACTATCACACATCAACTGCAACTCCAAAGCCACCCCTCACCCACTAGGATACCAACAAACCTACCCACCCTTAACAGTACATAGTACATAAAGTCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCCTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCCCTCAGATAGGGGTCCCTTGACCACCATCCTCCGTGAAATCAATATCCCGCACAAGAGTGCTACTCTCCTCGCTCCGGGCCCATAACACTTGGGGGTAGCTAAAGTGAACTGTATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGCCATAAAGCCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATG
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new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..f9a0c7ef39e917909a6c4c884fc8269868a6ed14
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna_align_feature.sql
@@ -0,0 +1,22 @@
+CREATE TABLE `dna_align_feature` (
+  `dna_align_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(1) NOT NULL default '0',
+  `hit_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `hit_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `hit_strand` tinyint(1) NOT NULL default '0',
+  `hit_name` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `score` double default NULL,
+  `evalue` double default NULL,
+  `perc_ident` float default NULL,
+  `cigar_line` text collate latin1_bin,
+  PRIMARY KEY  (`dna_align_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`analysis_id`,`seq_region_start`,`score`),
+  KEY `seq_region_idx_2` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `hit_idx` (`hit_name`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=100000000 AVG_ROW_LENGTH=80;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna_align_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna_align_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..27e11f2591f3ae02986f49cddd59c2dabe437920
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/dna_align_feature.txt
@@ -0,0 +1,27166 @@
+1449321	317101	10787	10882	1	426	521	1	AK014905.1	7	124	1.5e-17	27	96M
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+11290104	317101	10817	10909	1	114	206	1	AK006027.1	7	825	1.2e-183	96	93M
+11290143	317101	10817	10909	1	94	186	1	AK015740.1	7	821	4.3e-182	95	93M
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+11505482	318770	83816	83872	1	590	646	1	Hs.144774	9	275	2e-20	45	57M
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+12065716	319047	10372	10446	-1	1989	2063	1	Rn.64643	9	259	1.1e-18	35	75M
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+20051636	319047	10198	10347	-1	302	451	1	BG807839.1	12	223	8.2e-17	30	150M
+20051674	319047	10198	10347	-1	280	429	1	BI979840.1	12	268	3e-21	34	150M
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+20051495	319047	10357	10392	1	246	281	1	BJ044476.1	12	229	1.4e-17	32	36M
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+4141351	319047	10534	10647	-1	474	587	1	BI664668.1	12	144	2.9e-06	30	114M
+4141380	319047	10534	10647	-1	248	361	1	BJ004493.1	12	139	6.2e-07	22	114M
+4141384	319047	10534	10647	-1	266	379	1	BB026973.2	12	139	7.9e-06	31	114M
+4141393	319047	10534	10647	-1	413	526	1	BB549093.2	12	128	0.00013	32	114M
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+19553577	469270	30909	30959	1	140	190	1	Rn.21287	9	167	1.6e-08	37	51M
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+4011150	469270	31149	31226	1	507	584	1	Hs.7647	9	127	0.00031	38	78M
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+4011436	469270	31182	31208	-1	555	581	1	Ta.2122	9	135	3.1e-05	31	27M
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+19553405	469270	31182	31232	-1	3640	3690	1	Hs.343820	9	156	4.2e-09	43	51M
+19553510	469270	31182	31190	-1	191	199	1	Os.4752	9	152	7.8e-07	38	9M
+19553564	469270	31182	31229	1	401	448	1	Rn.21287	9	158	1.5e-07	38	48M
+19553570	469270	31182	31214	1	401	433	1	Rn.21287	9	167	1.6e-08	37	33M
+19553329	469270	31185	31214	1	359	388	1	Os.3495	9	151	7.1e-12	36	30M
+4011029	469270	31188	31214	-1	184	210	1	Hv.2794	9	145	1.6e-08	31	27M
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+19553454	469270	31203	31310	1	524	631	1	Hs.144980	9	157	1.6e-07	32	108M
+4011049	469270	31206	31220	1	409	423	1	Hs.123022	9	143	7.1e-06	35	15M
+4011126	469270	31206	31229	1	1658	1681	1	Os.69	9	125	1.4e-05	33	24M
+4011280	469270	31206	31262	-1	249	305	1	Hs.24644	9	129	0.00023	34	57M
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+5815537	469270	34447	34479	1	1555	1587	1	BG755789.1	12	147	1.4e-06	28	33M
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `dnac` (
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `sequence` mediumblob NOT NULL,
+  `n_line` text collate latin1_bin,
+  PRIMARY KEY  (`seq_region_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=750000 AVG_ROW_LENGTH=19000;
+
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new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391
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new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..05211dedbeb369b3c835b6224ff6f760b8940505
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/exon.sql
@@ -0,0 +1,13 @@
+CREATE TABLE `exon` (
+  `exon_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(2) NOT NULL default '0',
+  `phase` tinyint(2) NOT NULL default '0',
+  `end_phase` tinyint(2) NOT NULL default '0',
+  `is_current` BOOLEAN DEFAULT 1,
+  PRIMARY KEY  (`exon_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/exon.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/exon.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..22746a105a58406956a6e9c55b2723598e297725
--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,160 @@
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+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,9 @@
+CREATE TABLE `exon_transcript` (
+  `exon_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `transcript_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `rank` int(10) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`exon_id`,`transcript_id`,`rank`),
+  KEY `transcript` (`transcript_id`),
+  KEY `exon` (`exon_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
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new file mode 100644
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/exon_transcript.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_db.sql
@@ -0,0 +1,13 @@
+CREATE TABLE `external_db` (
+  `external_db_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `db_name` varchar(27) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `db_release` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `status` enum('KNOWNXREF','KNOWN','XREF','PRED','ORTH','PSEUDO') collate latin1_bin NOT NULL default 'KNOWNXREF',
+  `dbprimary_acc_linkable` tinyint(1) NOT NULL default '1',
+  `display_label_linkable` tinyint(1) NOT NULL default '0',
+  `priority` int(11) NOT NULL default '0',
+  `db_display_name` varchar(255) collate latin1_bin default NULL,
+  `type`  ENUM('ARRAY', 'ALT_TRANS', 'MISC', 'LIT'),
+  PRIMARY KEY  (`external_db_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_db.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_db.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_db.txt
@@ -0,0 +1,110 @@
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+805	flybase_symbol	1	KNOWNXREF	1	0	50	Flybase Symbol	MISC
+806	flybase_synonym	1	KNOWNXREF	1	0	5	Flybase Synonym	MISC
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+3	protein_id	1	KNOWNXREF	1	0	5	Protein ID	MISC
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+1805	RefSeq_dna_predicted	1	PRED	1	0	15	RefSeq DNA predicted	MISC
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+1815	RefSeq_peptide_predicted	1	PRED	1	0	16	RefSeq peptide predicted	MISC
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+1901	Sanger_Hver1_3_1	1	XREF	1	0	5	Sanger Hver 131	MISC
+1902	SNGR_Hver	1	XREF	1	0	5	Sanger Hver	MISC
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+2430	wormbase_pseudogene	1	PSEUDO	1	0	5	Wormbase Pseudogene	MISC
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+4200	RFAM	1	XREF	1	0	5	RFAM	MISC
\ No newline at end of file
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_synonym.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `external_synonym` (
+  `xref_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `synonym` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  PRIMARY KEY  (`xref_id`,`synonym`),
+  KEY `name_index` (`synonym`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_synonym.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_synonym.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..7b747daf46843e779162b0f7d968b82f0f608071
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/external_synonym.txt
@@ -0,0 +1,3 @@
+315	syn1
+315	syn2
+994	syn3
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..9e32f926835342cc1d9998eed8b268dc4fc34042
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene.sql
@@ -0,0 +1,19 @@
+CREATE TABLE `gene` (
+  `gene_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `biotype` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `analysis_id` int(11) default NULL,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(2) NOT NULL default '0',
+  `display_xref_id` int(10) unsigned default NULL,
+  `source` varchar(20) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `status` enum('KNOWN','NOVEL','PUTATIVE','PREDICTED','KNOWN_BY_PROJECTION') collate latin1_bin default NULL,
+  `description` text collate latin1_bin,
+  `is_current` BOOLEAN DEFAULT 1,
+  PRIMARY KEY  (`gene_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `xref_id_index` (`display_xref_id`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..6adb3d069a716b32e01dafbf600f08f578555d9f
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene.txt
@@ -0,0 +1,20 @@
+18256	protein_coding	1282	469283	30274334	30300924	1	152202	ensembl	KNOWN	DJ310O13.1.2 (NOVEL PROTEIN SIMILAR DROSOPHILA PROTEIN CG7474, ISOFORM 2 ) (FRAGMENT). [Source:SPTREMBL;Acc:Q9BR18]	1
+18257	protein_coding	1282	469283	30301733	30318881	1	0	ensembl	NOVEL	\N	1
+18258	protein_coding	1282	469283	30320853	30327869	-1	40090	ensembl	KNOWN	\N	1
+18259	protein_coding	1282	469283	30371004	30372906	1	102413	ensembl	KNOWN	DJ310O13.4 (NOVEL PROTEIN SIMILAR TO PREDICTED C. ELEGANS AND C. INTESTINALIS PROTEINS) (FRAGMENT). [Source:SPTREMBL;Acc:Q9NUG5]	1
+18260	protein_coding	1282	469283	30386305	30408041	1	34986	ensembl	KNOWN	\N	1
+18261	protein_coding	1282	469283	30428114	30477716	1	158525	ensembl	KNOWN	TYROSINE-PROTEIN KINASE HCK (EC 2.7.1.112) (P59-HCK AND P60-HCK) (HEMOPOIETIC CELL KINASE). [Source:SWISSPROT;Acc:P08631]	1
+18262	protein_coding	1282	469283	30485596	30543114	1	120576	ensembl	KNOWN	TRANSMEMBRANE 9 SUPERFAMILY PROTEIN MEMBER 4. [Source:SWISSPROT;Acc:Q92544]	1
+18263	protein_coding	1282	469283	30565065	30566129	-1	128607	ensembl	KNOWN	BA392M18.1 (NOVEL PROTEIN SIMILAR TO TESTIS SPECIFIC PROTEIN TSPY). [Source:SPTREMBL;Acc:Q9H489]	1
+18264	protein_coding	1282	469283	30568364	30583588	-1	17034	ensembl	KNOWN	ZINC FINGER PROTEIN PLAGL2 (PLEIOMORPHIC ADENOMA-LIKE PROTEIN 2). [Source:SWISSPROT;Acc:Q9UPG8]	1
+18265	protein_coding	1282	469283	30583753	30614524	1	128597	ensembl	KNOWN	GDP-FUCOSE PROTEIN O-FUCOSYLTRANSFERASE 1 PRECURSOR (EC 2.4.1.-) (O- FUCOSYLTRANSFERASE) (O-FUCT-1). [Source:SPTREMBL;Acc:Q9H488]	1
+18266	protein_coding	1282	469283	30653524	30709209	1	28819	ensembl	KNOWN	KINESIN-LIKE PROTEIN KIF3B (MICROTUBULE PLUS END-DIRECTED KINESIN MOTOR 3B) (HH0048). [Source:SWISSPROT;Acc:O15066]	1
+18267	protein_coding	1282	469283	30735607	30815178	1	128324	ensembl	KNOWN	BA358N2.1 (KIAA0978) (FRAGMENT). [Source:SPTREMBL;Acc:Q9H466]	1
+18268	protein_coding	1282	469283	30822726	30859269	-1	34892	ensembl	KNOWN	\N	1
+18269	protein_coding	1282	469283	30885729	30911383	-1	89323	ensembl	KNOWN	DJ1184F4.4 (NOVEL PROTEIN SIMILAR TO NUCLEOLAR PROTEIN 4 (NOL4) (NOLP)). [Source:SPTREMBL;Acc:Q9NQF5]	1
+18270	protein_coding	1282	469283	31070930	31071301	-1	332	ensembl	KNOWN	\N	1
+18271	protein_coding	1282	469283	31074431	31089984	-1	168324	ensembl	KNOWN	\N	1
+18272	protein_coding	1282	469283	31108924	31155894	1	15966	ensembl	KNOWN	DNA (CYTOSINE-5)-METHYLTRANSFERASE 3B (EC 2.1.1.37) (DNMT3B) (DNA METHYLTRANSFERASE HSAIIIB) (DNA MTASE HSAIIIB) (M.HSAIIIB). [Source:SWISSPROT;Acc:Q9UBC3]	1
+18273	protein_coding	1282	469283	31166507	31196939	1	97759	ensembl	KNOWN	MICROTUBULE-ASSOCIATED PROTEIN RP/EB FAMILY MEMBER 1 (APC-BINDING PROTEIN EB1). [Source:SWISSPROT;Acc:Q15691]	1
+18274	protein_coding	1282	469283	31210077	31225346	1	0	ensembl	NOVEL	\N	1
+18275	protein_coding	1282	965899	10060	10405	1	0	ensembl	NOVEL	\N	1
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_archive.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_archive.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..00a725649aa0aa8bd213f35e6d67f0955d987778
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_archive.sql
@@ -0,0 +1,14 @@
+CREATE TABLE `gene_archive` (
+  `gene_stable_id` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `gene_version` smallint(6) NOT NULL default '0',
+  `transcript_stable_id` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `transcript_version` smallint(6) NOT NULL default '0',
+  `translation_stable_id` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `translation_version` smallint(6) NOT NULL default '0',
+  `peptide_archive_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `mapping_session_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  KEY `gene_idx` (`gene_stable_id`,`gene_version`),
+  KEY `transcript_idx` (`transcript_stable_id`,`transcript_version`),
+  KEY `translation_idx` (`translation_stable_id`,`translation_version`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_archive.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_archive.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..f03e40d411859871cc38d912b19ae12d48ba945d
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_archive.txt
@@ -0,0 +1,12 @@
+G2	1	T2	1	P2	1	1	1
+G3	1	T4	1	P4	1	2	1
+G3	1	T5	1	P5	1	3	1
+G4	1	T1	1	P1	1	4	2
+G2	2	T2	2	P2	1	1	2
+G2	2	T3	1	P3	1	5	2
+G3	2	T4	2	P4	2	6	2
+G3	2	T5	1	P5	1	3	2
+G1	1	T6	1	P6	1	7	3
+G2	3	T2	3	P2	2	8	3
+G3	3	T3	2	P3	2	9	3
+G3	3	T8	1	P8	1	10	3
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_attrib.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_attrib.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..f62803526063f67a59749307e0280461256860f3
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_attrib.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `gene_attrib` (
+  `gene_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `attrib_type_id` smallint(5) unsigned NOT NULL default '0',
+  `value` varchar(255) NOT NULL default '',
+  KEY `type_val_idx` (`attrib_type_id`,`value`),
+  KEY `gene_idx` (`gene_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_attrib.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_attrib.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..20d48d3f602f5bf10340fd31783fc15c3033aa48
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_attrib.txt
@@ -0,0 +1,2 @@
+18256	10	This is a note on gene 18256
+18259	10	Another note on gene 18259
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_stable_id.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_stable_id.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..2158f71814e521de570e0cd9542cc0f8138668dd
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_stable_id.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `gene_stable_id` (
+  `gene_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `stable_id` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `version` int(10) default NULL,
+  `created_date` datetime NOT NULL default '0000-00-00 00:00:00',
+  `modified_date` datetime NOT NULL default '0000-00-00 00:00:00',
+  PRIMARY KEY  (`gene_id`),
+  KEY `stable_id` (`stable_id`,`version`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_stable_id.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_stable_id.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..b705b9637c3c1dfbf518a19b5356be0d6fcb4fac
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/gene_stable_id.txt
@@ -0,0 +1,20 @@
+18256	ENSG00000131044	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18257	ENSG00000174873	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18258	ENSG00000088356	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18259	ENSG00000101321	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18260	ENSG00000101331	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18261	ENSG00000101336	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18262	ENSG00000101337	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18263	ENSG00000125979	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18264	ENSG00000126003	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18265	ENSG00000101346	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18266	ENSG00000101350	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18267	ENSG00000171456	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18268	ENSG00000125964	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18269	ENSG00000088303	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18270	ENSG00000174852	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18271	ENSG00000149600	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18272	ENSG00000088305	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18273	ENSG00000101367	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18274	ENSG00000167097	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+18275	ENSG00000355555	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/go_xref.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/go_xref.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..feb71cdea15b9999e1585bea69a28b659a1bd943
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/go_xref.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `go_xref` (
+  `object_xref_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `linkage_type` enum('IC','IDA','IEA','IEP','IGI','IMP','IPI','ISS','NAS','ND','TAS','NR', 'RCA') collate latin1_bin NOT NULL default 'IC',
+  UNIQUE KEY `object_xref_id_2` (`object_xref_id`,`linkage_type`),
+  KEY `object_xref_id` (`object_xref_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/go_xref.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/go_xref.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..efbac7a3b24400eb748b879b2de0b4a0df03d9f9
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/go_xref.txt
@@ -0,0 +1,49 @@
+22988	IC
+22988	IEA
+22989	IEA
+22990	IC
+22991	IEA
+22992	IC
+22993	IEA
+22994	IC
+41176	IEA
+41177	IDA
+41178	IEA
+41179	IC
+41180	IEA
+41181	IEA
+41182	IDA
+41183	IC
+83268	IEA
+83269	IEA
+83270	IDA
+149843	IDA
+151219	IDA
+151220	IC
+151221	IDA
+151222	IC
+151223	IEA
+151224	IC
+179294	IDA
+179295	IEA
+179296	IC
+191222	IEA
+191223	IC
+191224	IC
+191225	IC
+191226	IDA
+191227	IDA
+191244	IEA
+191245	IDA
+191246	IC
+229064	IDA
+229065	IC
+229077	IDA
+229078	IC
+238791	IC
+238792	IDA
+238793	IDA
+238794	IC
+238795	IDA
+238796	IEA
+238797	IDA
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/identity_xref.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/identity_xref.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..73b4aab1ef74e8a2bd2c69a8ac92cd3fdaa93ef8
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/identity_xref.sql
@@ -0,0 +1,16 @@
+CREATE TABLE `identity_xref` (
+  `object_xref_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `query_identity` int(5) default NULL,
+  `target_identity` int(5) default NULL,
+  `hit_start` int(11) default NULL,
+  `hit_end` int(11) default NULL,
+  `translation_start` int(11) default NULL,
+  `translation_end` int(11) default NULL,
+  `cigar_line` text collate latin1_bin,
+  `score` double default NULL,
+  `evalue` double default NULL,
+  `analysis_id` int(11) default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`object_xref_id`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/identity_xref.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/identity_xref.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..197deefc76f8b0bad0195b313a85c02e5996415c
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/identity_xref.txt
@@ -0,0 +1,32 @@
+500	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+22968	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+24440	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+41169	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+42617	99	99	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+49607	99	99	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+49727	97	97	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+52553	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+54721	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+56601	89	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+72763	97	97	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+76579	99	99	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+83261	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+104881	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+130254	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+130257	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+142713	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+149839	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+149844	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+149848	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+151214	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+179285	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+190803	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+191214	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+191240	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+229061	95	83	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+229073	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+229273	55	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+238768	99	99	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+251369	95	99	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+253531	100	45	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
+253682	100	100	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N	\N
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/interpro.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/interpro.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..65ac6ee32ed4daf483ba1b2fdab6715069e88f40
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/interpro.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `interpro` (
+  `interpro_ac` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `id` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  UNIQUE KEY `interpro_ac` (`interpro_ac`,`id`),
+  KEY `id` (`id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/interpro.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/interpro.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..c52307984cf6f728c6939a2f67caaa2be04107a8
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/interpro.txt
@@ -0,0 +1,2 @@
+IPR000001	PF000001
+IPR000010	PF000019
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/karyotype.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/karyotype.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..4625cf675fb11bf4427d06843d64cb0710e76371
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/karyotype.sql
@@ -0,0 +1,11 @@
+CREATE TABLE `karyotype` (
+  `karyotype_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `band` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `stain` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  PRIMARY KEY  (`karyotype_id`),
+  KEY `region_band_idx` (`seq_region_id`,`band`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/karyotype.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/karyotype.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..9e21bfab5021885537cd0adbfea047a6909afa64
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/karyotype.txt
@@ -0,0 +1 @@
+1	469283	30200000	32600000	q11.21	gneg
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/map.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/map.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..e2461ed54ea7134a405e1af61b9eb649f7474ab0
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/map.sql
@@ -0,0 +1,6 @@
+CREATE TABLE `map` (
+  `map_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `map_name` varchar(30) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  PRIMARY KEY  (`map_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/map.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/map.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..f862d0136a5b00fdd7ccea42313295a73d3b5667
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/map.txt
@@ -0,0 +1,8 @@
+1	genethon
+2	marshfield
+3	decode
+4	gm99gb4
+5	gm99g3
+6	tng
+7	wiyac
+8	wirh
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/mapping_session.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/mapping_session.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..d9cc3baa30f214099b516e9fb7c083e52a9093d7
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/mapping_session.sql
@@ -0,0 +1,15 @@
+CREATE TABLE mapping_session (
+
+  mapping_session_id 	      INT(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
+  old_db_name                 VARCHAR(80) NOT NULL DEFAULT '',
+  new_db_name                 VARCHAR(80) NOT NULL DEFAULT '',
+  old_release                 VARCHAR(5) NOT NULL DEFAULT '',
+  new_release                 VARCHAR(5) NOT NULL DEFAULT '',
+  old_assembly                VARCHAR(20) NOT NULL DEFAULT '',
+  new_assembly                VARCHAR(20) NOT NULL DEFAULT '',
+  created                     DATETIME NOT NULL,
+
+  PRIMARY KEY (mapping_session_id)
+
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/mapping_session.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/mapping_session.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..e3890d1e6934c4947b1e80a9eff126fc97b3bf4f
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/mapping_session.txt
@@ -0,0 +1,3 @@
+1	release_1	release_2	1	2	assembly_1	assembly_2	2002-04-01 00:00:00
+2	release_2	release_3	2	3	assembly_2	assembly_3	2002-12-24 00:00:00
+3	release_3	release_4	3	4	assembly_3	assembly_4	2003-03-03 00:00:00
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..db6e76febf4face522576e8b0407c3d98155f51d
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker.sql
@@ -0,0 +1,13 @@
+CREATE TABLE `marker` (
+  `marker_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `display_marker_synonym_id` int(10) unsigned default NULL,
+  `left_primer` varchar(100) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `right_primer` varchar(100) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `min_primer_dist` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `max_primer_dist` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `priority` int(11) default NULL,
+  `type` enum('est','microsatellite') collate latin1_bin default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`marker_id`),
+  KEY `marker_idx` (`marker_id`,`priority`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..537d27e0ae60325fd8c16378564a9f9f7e4fc268
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker.txt
@@ -0,0 +1,100 @@
+1	0	CACACAGGCTCACATGCC	GCTCCAGCGTCATGGACT	142	170	0	\N
+2	0	AATTAACCGTTTTGGTCCT	GCGACACACACTTCCC	173	191	0	\N
+3	0	CCAAAGGGTGCTTCTC	GTGGCATTCCAACCTC	171	223	0	\N
+4	0	AAAACATCAACTCTCCCCTG	CTCAAACCCCAATAAGCCTT	185	223	0	\N
+5	0	CACACATGCACATGCAC	AGTGACACCAGCAGGG	221	261	0	\N
+6	0	ACCATGCCCGGCTAAT	GTGCACATCACCATACCTG	227	273	0	\N
+7	0	TTAGTTGGATTAGACACGGC	GAGACCCTGATGACTGTGG	190	224	0	\N
+8	0	CCGAATGACAAGGTGAGACT	AATGTTGTTTCCAAAGTGGC	120	142	0	\N
+9	0	AGAAGGCTGAGGTAGGAG	CCATTCACATTTAACCTGTC	179	185	0	\N
+10	0	GATCATGCCAATGCACTAT	CCAGGGTGACACAGCA	190	212	0	\N
+11	0	GCGATGCTGCCGTTCAA	CCCAGACTGTGTGCAGAGTGTG	180	192	0	\N
+12	0	TGCGCTACTAAGCCCCT	TTACCGGACGCCACAC	164	172	0	\N
+13	0	ATGACTGTTCTCTGTTTTAGGAACC	CAGTTGTTGGGAAGCG	173	205	0	\N
+14	0	AGGTCCAAGAAGCGGAG	TCACGGGGTATTAAGTGG	241	255	0	\N
+15	0	AGCGAAACTCCATCTCAG	TGCCTATGCTTTTGAGGT	181	193	0	\N
+16	0	AGCTGGGGAATATATGTNTCATAT	TGTGGAAGGCCAACTC	73	85	0	\N
+17	0	GCTCCAATGTCCAAGGG	GGGTACTCAGATGGCTGGT	243	267	0	\N
+18	0	GAGCAGCACCGTACAAAT	AGCTCCGCTCCCTGTAAT	285	296	0	\N
+19	0	CCTCCAGGGTATTCTTGG	TTTTTGAGGTGTGAGAGCAG	122	132	0	\N
+20	0	CTACCTGCGGGGACAC	ACACTGGGTTGAGGGC	203	213	0	\N
+21	0	AGCTTCAGGTCTGGGGGACA	CTGGGTTTACCCTCCAGCGA	224	272	0	\N
+22	0	AGCCTTTTGATACTCTTACTGTGG	GGGGCTGGGGTAGTTT	80	104	0	\N
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+24	0	AGCCAGACCAAGTCTCAACA	ACAAAATGATGGGGTTATGG	141	153	0	\N
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_feature.sql
@@ -0,0 +1,13 @@
+CREATE TABLE `marker_feature` (
+  `marker_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `marker_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `map_weight` int(10) unsigned default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`marker_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..38762f59c73a9ef4f0c2263dbf1e09295ad5af72
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_feature.txt
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_map_location.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_map_location.sql
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_map_location.sql
@@ -0,0 +1,11 @@
+CREATE TABLE `marker_map_location` (
+  `marker_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `map_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `chromosome_name` varchar(15) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `marker_synonym_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `position` varchar(15) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `lod_score` double default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`marker_id`,`map_id`),
+  KEY `map_idx` (`map_id`,`chromosome_name`,`position`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_map_location.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_map_location.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..d642434b6b1f9357475d5ee9b8567b89ca27298a
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_map_location.txt
@@ -0,0 +1,412 @@
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_synonym.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `marker_synonym` (
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+  PRIMARY KEY  (`marker_synonym_id`),
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+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_synonym.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/marker_synonym.txt
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+1062	100	unists	13678
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index 0000000000000000000000000000000000000000..d3bd7f3d2e0200d966dfd9e0ecb6d599e60fd3e5
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta.sql
@@ -0,0 +1,9 @@
+CREATE TABLE `meta` (
+  `meta_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `meta_key` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `meta_value` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  PRIMARY KEY  (`meta_id`),
+  KEY `meta_key_index` (`meta_key`),
+  KEY `meta_value_index` (`meta_value`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..87c0417c5cefd964408c0919012deb2e5a036a55
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta.txt
@@ -0,0 +1,24 @@
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+26	species.classification	Homo
+25	species.classification	sapiens
+34	species.classification	Metazoa
+35	species.classification	Eukaryota
+36	species.common_name	Human
+3	species.taxonomy_id	9606
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+59	assembly.mapping	chromosome:NCBI33|contig|supercontig
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+64	assembly.mapping	chromosome:NCBI33#chunk
+65	assembly.mapping	alt_chrom#chromosome:NCBI33
+66	assembly.mapping	alt_chrom|chromosome:NCBI33|contig
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta_coord.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `meta_coord` (
+  `table_name` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `coord_system_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `max_length` int(11) default NULL,
+  UNIQUE KEY `table_name` (`table_name`,`coord_system_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta_coord.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta_coord.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..49950703e1e45a027aba5076600c203068b66f9e
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/meta_coord.txt
@@ -0,0 +1,22 @@
+assembly_exception	1	500001
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+prediction_exon	1	101
+affy_feature	1	25
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+regulatory_search_region	1	121
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_attrib.sql
@@ -0,0 +1,8 @@
+CREATE TABLE `misc_attrib` (
+  `misc_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `attrib_type_id` smallint(5) unsigned NOT NULL default '0',
+  `value` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  KEY `type_val_idx` (`attrib_type_id`,`value`),
+  KEY `misc_feature_idx` (`misc_feature_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_attrib.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_attrib.txt
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index 0000000000000000000000000000000000000000..aa90fbf5e470d9b339309c8249c3cebe1575bca2
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_attrib.txt
@@ -0,0 +1,12 @@
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+5	10	This is a note type annotation
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index 0000000000000000000000000000000000000000..f01ec80d61514885ca15bce2b6e3fe3b01800ed4
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `misc_feature` (
+  `misc_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`misc_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature.txt
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index 0000000000000000000000000000000000000000..10e858981d2b5199bab052ae1eaed277c1b35fb9
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature.txt
@@ -0,0 +1,7 @@
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature_misc_set.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature_misc_set.sql
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index 0000000000000000000000000000000000000000..943163a6ed1249928188f8fb7f62badb5277ec98
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature_misc_set.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `misc_feature_misc_set` (
+  `misc_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `misc_set_id` smallint(5) unsigned NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`misc_feature_id`,`misc_set_id`),
+  KEY `reverse_idx` (`misc_set_id`,`misc_feature_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature_misc_set.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature_misc_set.txt
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index 0000000000000000000000000000000000000000..31ebb7305419b79966056f8beca0c3c7e6b5b5ae
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_feature_misc_set.txt
@@ -0,0 +1,7 @@
+1	1
+2	1
+3	1
+4	2
+5	2
+6	2
+7	2
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `misc_set` (
+  `misc_set_id` smallint(5) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `code` varchar(25) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `name` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `description` text collate latin1_bin NOT NULL,
+  `max_length` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`misc_set_id`),
+  UNIQUE KEY `c` (`code`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_set.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_set.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/misc_set.txt
@@ -0,0 +1,4 @@
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+8	gap	Gaps		50000000
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index 0000000000000000000000000000000000000000..f5c3bf6d09c0f3918232089ee774d3c887a98e78
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/object_xref.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `object_xref` (
+  `object_xref_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `ensembl_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `ensembl_object_type` enum('RawContig','Transcript','Gene','Translation','regulatory_factor','regulatory_feature') collate latin1_bin NOT NULL default 'RawContig',
+  `xref_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  UNIQUE KEY `ensembl_object_type` (`ensembl_object_type`,`ensembl_id`,`xref_id`),
+  KEY `oxref_idx` (`object_xref_id`,`xref_id`,`ensembl_object_type`,`ensembl_id`),
+  KEY `xref_idx` (`xref_id`,`ensembl_object_type`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/object_xref.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/object_xref.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/object_xref.txt
@@ -0,0 +1,205 @@
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_array.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_array.sql
new file mode 100644
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_array.sql
@@ -0,0 +1,9 @@
+CREATE TABLE `oligo_array` (
+  `oligo_array_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `parent_array_id` int(11) default NULL,
+  `probe_setsize` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `name` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `type` ENUM('AFFY', 'OLIGO'),
+  PRIMARY KEY  (`oligo_array_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_array.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_array.txt
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_feature.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_feature.sql
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_feature.sql
@@ -0,0 +1,14 @@
+CREATE TABLE `oligo_feature` (
+  `oligo_feature_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `mismatches` tinyint(4) default NULL,
+  `oligo_probe_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `analysis_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`oligo_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `probe_idx` (`oligo_probe_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_feature.txt
new file mode 100644
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_probe.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_probe.sql
new file mode 100644
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_probe.sql
@@ -0,0 +1,12 @@
+CREATE TABLE `oligo_probe` (
+  `oligo_probe_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `oligo_array_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `probeset` varchar(40) collate latin1_bin default NULL,
+  `name` varchar(20) collate latin1_bin default NULL,
+  `description` text collate latin1_bin default NULL,
+  `length` smallint(5) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`oligo_probe_id`,`oligo_array_id`),
+  KEY `probeset_idx` (`probeset`),
+  KEY `array_idx` (`oligo_array_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_probe.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/oligo_probe.txt
new file mode 100644
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/peptide_archive.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/peptide_archive.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..365fd143cbfbfb5ccd1a224c21b73c8d405a0d97
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/peptide_archive.sql
@@ -0,0 +1,8 @@
+CREATE TABLE `peptide_archive` (
+  `peptide_archive_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `md5_checksum` varchar(32) default NULL,
+  `peptide_seq` mediumtext NOT NULL,
+  PRIMARY KEY  (`peptide_archive_id`),
+  KEY `checksum` (`md5_checksum`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/peptide_archive.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/peptide_archive.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..d27e6c16844a83e3c9203f3108fd0244c9e50dbe
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/peptide_archive.txt
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,16 @@
+CREATE TABLE `prediction_exon` (
+  `prediction_exon_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `prediction_transcript_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `exon_rank` smallint(5) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `start_phase` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `score` double default NULL,
+  `p_value` double default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`prediction_exon_id`),
+  KEY `prediction_transcript_id` (`prediction_transcript_id`),
+  KEY `seq_region_id` (`seq_region_id`,`seq_region_start`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/prediction_exon.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/prediction_exon.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..622a8ecdae507728c5f2bac4d16cff3b4bbbd9ab
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/prediction_exon.txt
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+  `prediction_transcript_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
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+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `analysis_id` int(11) default NULL,
+  `display_label` varchar(255) collate latin1_bin default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`prediction_transcript_id`),
+  KEY `seq_region_id` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_align_feature.sql
@@ -0,0 +1,21 @@
+CREATE TABLE `protein_align_feature` (
+  `protein_align_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
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+  `hit_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `hit_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `hit_name` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `score` double default NULL,
+  `evalue` double default NULL,
+  `perc_ident` float default NULL,
+  `cigar_line` text collate latin1_bin,
+  PRIMARY KEY  (`protein_align_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`analysis_id`,`seq_region_start`,`score`),
+  KEY `seq_region_idx_2` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `hit_idx` (`hit_name`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=100000000 AVG_ROW_LENGTH=80;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_align_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_align_feature.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_align_feature.txt
@@ -0,0 +1,7234 @@
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_feature.sql
@@ -0,0 +1,18 @@
+CREATE TABLE `protein_feature` (
+  `protein_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `translation_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_start` int(10) NOT NULL default '0',
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+  `hit_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `hit_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `hit_id` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `score` double NOT NULL default '0',
+  `evalue` double default NULL,
+  `perc_ident` float default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`protein_feature_id`),
+  KEY `translation_id` (`translation_id`),
+  KEY `hid_index` (`hit_id`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..442be67894da2478be4df583fb2ba4efa0e23260
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/protein_feature.txt
@@ -0,0 +1,156 @@
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+161514	21723	215	229	40	70	0	41	349	7e-07	0
+161516	21723	81	91	40	70	0	41	266	3.18e-05	0
+161518	21723	95	110	40	70	0	41	334	1.38e-07	0
+161520	21723	111	120	40	70	0	41	225	0.0222	0
+161522	21723	124	136	40	70	0	41	341	1.82e-06	0
+161524	21723	83	103	40	70	0	41	565	7.11e-09	0
+161526	21723	103	119	40	70	0	41	188	0.099	0
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+217504	21723	264	513	49	79	294	41	260.8	1.2e-75	0
+242780	21723	244	526	71	101	0	41	0	2.3e-79	0
+242781	21723	138	282	71	101	0	41	0	1.3e-33	0
+242782	21723	81	162	71	101	0	41	0	2.5e-22	0
+24549	21724	263	285	46	76	0	41	0	0	0
+24550	21724	329	351	46	76	0	41	0	0	0
+24551	21724	361	383	46	76	0	41	0	0	0
+24552	21724	396	418	46	76	0	41	0	0	0
+24553	21724	433	455	46	76	0	41	0	0	0
+24554	21724	483	505	46	76	0	41	0	0	0
+24555	21724	515	537	46	76	0	41	0	0	0
+24556	21724	550	572	46	76	0	41	0	0	0
+24557	21724	587	609	46	76	0	41	0	0	0
+83054	21724	270	275	44	74	0	41	0.92	0	0
+83055	21724	326	335	44	74	0	41	1.97	0	0
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+217397	21725	146	331	49	79	324	41	84.5	1.4e-22	0
+83060	21726	369	397	44	74	0	41	2.53	0	0
+83061	21726	417	432	44	74	0	41	2.3	0	0
+83062	21726	443	458	44	74	0	41	2.43	0	0
+116152	21726	70	92	42	72	0	41	1	0	0
+116153	21726	100	120	42	72	0	41	1	0	0
+116154	21726	129	149	42	72	0	41	1	0	0
+116155	21726	158	178	42	72	0	41	1	0	0
+116156	21726	193	213	42	72	0	41	0	0	0
+116157	21726	221	242	42	72	0	41	1	0	0
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+242784	21726	80	124	71	101	0	41	0	1.5e-09	0
+242785	21726	205	245	71	101	0	41	0	7.5e-09	0
+242786	21726	58	85	71	101	0	41	0	0.0011	0
+34517	21727	1	26	43	73	0	41	0	0	0
+83063	21727	15	22	44	74	0	41	0.81	0	0
+34518	21728	1	26	43	73	0	41	0	0	0
+83064	21728	15	22	44	74	0	41	0.81	0	0
+27435	21729	355	375	45	75	0	41	0	0	0
+27437	21729	436	473	45	75	0	41	0	0	0
+27440	21729	482	519	45	75	0	41	0	0	0
+27443	21729	541	579	45	75	0	41	0	0	0
+83065	21729	6	17	44	74	0	41	2.13	0	0
+83066	21729	370	407	44	74	0	41	2.15	0	0
+83067	21729	437	458	44	74	0	41	2.44	0	0
+83068	21729	493	514	44	74	0	41	2.5	0	0
+83069	21729	537	548	44	74	0	41	1.9	0	0
+83070	21729	685	697	44	74	0	41	2.26	0	0
+83071	21729	711	735	44	74	0	41	2.42	0	0
+116158	21729	96	103	42	72	0	41	0	0	0
+116159	21729	239	250	42	72	0	41	1	0	0
+130111	21729	6	256	41	71	0	41	55.446	0	0
+161528	21729	87	108	40	70	0	41	911	4.44e-16	0
+161530	21729	206	223	40	70	0	41	585	2.63e-10	0
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+161534	21729	290	311	40	70	0	41	833	4.44e-16	0
+217672	21729	55	341	49	79	373	41	576.3	1.3e-170	0
+242791	21729	4	365	71	101	0	41	0	8.4e-131	0
+83072	21730	3	16	44	74	0	41	1.78	0	0
+83073	21730	140	153	44	74	0	41	2.15	0	0
+83074	21730	442	469	44	74	0	41	1.89	0	0
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+83076	21730	1221	1235	44	74	0	41	2.15	0	0
+83077	21730	1250	1264	44	74	0	41	2.2	0	0
+83078	21731	194	211	44	74	0	41	1.95	0	0
+83079	21731	335	348	44	74	0	41	2.15	0	0
+83080	21731	637	664	44	74	0	41	1.89	0	0
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+83082	21732	33	61	44	74	0	41	2.68	0	0
+83083	21732	161	178	44	74	0	41	1.83	0	0
+83084	21732	375	396	44	74	0	41	1.93	0	0
+116160	21732	92	102	42	72	0	41	0	0	0
+130113	21732	235	252	41	71	0	41	3	0	0
+83085	21735	76	95	44	74	0	41	2.54	0	0
+83086	21735	104	122	44	74	0	41	2.65	0	0
+83087	21736	5	20	44	74	0	41	1.92	0	0
+83088	21737	47	65	44	74	0	41	2.35	0	0
+83089	21737	72	83	44	74	0	41	1.65	0	0
+83090	21737	110	125	44	74	0	41	2.42	0	0
+83091	21737	142	154	44	74	0	41	2.16	0	0
+83092	21737	166	177	44	74	0	41	2.08	0	0
+83093	21737	565	576	44	74	0	41	1.96	0	0
+116161	21737	309	316	42	72	0	41	0	0	0
+116162	21737	643	655	42	72	0	41	0	0	0
+217810	21737	223	296	49	79	87	41	121	1.5e-33	0
+217811	21737	576	849	49	79	418	41	-74	8.5e-06	0
+242841	21737	573	848	71	101	0	41	0	3e-50	0
+242842	21737	216	351	71	101	0	41	0	1.2e-41	0
+27455	21738	193	213	45	75	0	41	0	0	0
+83094	21738	256	267	44	74	0	41	2.12	0	0
+130115	21738	14	116	41	71	0	41	8.924	0	0
+217326	21738	15	117	49	79	106	41	28	1.5e-05	0
+217327	21738	210	257	49	79	56	41	106	4.7e-29	0
+242845	21738	13	115	71	101	0	41	0	3e-17	0
+83095	21739	44	56	44	74	0	41	2.19	0	0
+130117	21739	144	201	41	71	0	41	9.695	0	0
+217297	21739	141	168	49	79	29	41	4.4	1.7	0
+217298	21739	176	204	49	79	29	41	12.7	0.15	0
+242846	21739	117	207	71	101	0	41	0	4e-10	0
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..19a6486f29d03a7f3296a6ba2b4911698e7baae5
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl.sql
@@ -0,0 +1,11 @@
+CREATE TABLE `qtl` (
+  `qtl_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `trait` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `lod_score` float default NULL,
+  `flank_marker_id_1` int(11) default NULL,
+  `flank_marker_id_2` int(11) default NULL,
+  `peak_marker_id` int(11) default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`qtl_id`),
+  KEY `trait_idx` (`trait`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..3f344c710701fcc10ff755156c4df556890e762f
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl.txt
@@ -0,0 +1,2 @@
+1	stupidity	-0.2	20	92	94
+2	long nose	-0.1	20	65	66
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_feature.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_feature.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..fc6b072f319d9f3083fffb6bf984f9c209ecf5ba
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_feature.sql
@@ -0,0 +1,11 @@
+CREATE TABLE `qtl_feature` (
+  `seq_region_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `qtl_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `analysis_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  KEY `qtl_id` (`qtl_id`),
+  KEY `loc_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..ec2e54599fbf531f6d5ed7881451a781ddea5050
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_feature.txt
@@ -0,0 +1,2 @@
+469283	30100000	30400000	1	10
+469283	30268968	31005297	2	10
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_synonym.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_synonym.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..9a4e0ea36489dc6934b41a8cb2a0194a34267d8e
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_synonym.sql
@@ -0,0 +1,9 @@
+CREATE TABLE `qtl_synonym` (
+  `qtl_synonym_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `qtl_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `source_database` enum('rat genome database','ratmap') collate latin1_bin NOT NULL default 'rat genome database',
+  `source_primary_id` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  PRIMARY KEY  (`qtl_synonym_id`),
+  KEY `qtl_idx` (`qtl_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_synonym.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_synonym.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..7a521fc97f20d97dddfeaa7ccbed8d779b8d583c
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/qtl_synonym.txt
@@ -0,0 +1,3 @@
+1	1	rat genome database	rqtl1
+2	1	ratmap	rmqtl1
+3	2	rat genome database	rqtl2
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..4f0483aae1f152cf8f16f3c0a88a23c34078faff
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor.sql
@@ -0,0 +1,7 @@
+CREATE TABLE `regulatory_factor` (
+  `regulatory_factor_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `name` varchar(255) NOT NULL default '',
+  `type` enum('miRNA_target','transcription_factor','transcription_factor_complex') default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`regulatory_factor_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..2a5dcec08ed73e19af69b042af88a226d59115e5
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor.txt
@@ -0,0 +1,36 @@
+1	hsa-miR-23b	miRNA_target
+2	hsa-miR-23a	miRNA_target
+3	hsa-miR-224	miRNA_target
+4	hsa-miR-138	miRNA_target
+5	hsa-miR-133b	miRNA_target
+6	hsa-miR-133a	miRNA_target
+7	gga-miR-133c	miRNA_target
+8	hsa-miR-200a	miRNA_target
+9	hsa-miR-27b	miRNA_target
+10	hsa-miR-139	miRNA_target
+11	gga-miR-124b	miRNA_target
+12	hsa-miR-124a	miRNA_target
+13	rno-miR-347	miRNA_target
+14	hsa-miR-337	miRNA_target
+15	hsa-miR-328	miRNA_target
+16	hsa-miR-296	miRNA_target
+17	hsa-miR-29a	miRNA_target
+18	hsa-miR-29b	miRNA_target
+19	hsa-miR-29c	miRNA_target
+20	hsa-miR-214	miRNA_target
+21	hsa-miR-195	miRNA_target
+22	hsa-miR-16	miRNA_target
+23	hsa-miR-146	miRNA_target
+24	hsa-miR-107	miRNA_target
+25	hsa-miR-103	miRNA_target
+26	rno-miR-343	miRNA_target
+27	hsa-miR-326	miRNA_target
+28	hsa-miR-145	miRNA_target
+29	hsa-miR-27a	miRNA_target
+30	hsa-miR-152	miRNA_target
+31	hsa-miR-148b	miRNA_target
+32	hsa-miR-148a	miRNA_target
+33	hsa-miR-144	miRNA_target
+34	hsa-miR-130a	miRNA_target
+35	trans_fac1	transcription_factor
+36	trans_fac2	transcription_factor
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor_coding.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor_coding.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..36003e6d341a1ebf2b9046b3d4dc07e9a2e72aeb
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor_coding.sql
@@ -0,0 +1,9 @@
+CREATE TABLE `regulatory_factor_coding` (
+  `regulatory_factor_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `transcript_id` int(11) default NULL,
+  `gene_id` int(11) default NULL,
+  KEY `transcript_idx` (`transcript_id`),
+  KEY `gene_idx` (`gene_id`),
+  KEY `regulatory_factor_idx` (`regulatory_factor_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor_coding.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor_coding.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..9c5014e786a780b6b62992976f8d8f4a99ffbf64
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_factor_coding.txt
@@ -0,0 +1,6 @@
+1	21716	\N
+2	21717	\N
+3	21720	\N
+4	\N	18265
+5	\N	18271
+6	\N	18275
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..e58c337d5cb62485e1cfff48ab6a5ee4f84c4ff8
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature.sql
@@ -0,0 +1,14 @@
+CREATE TABLE `regulatory_feature` (
+  `regulatory_feature_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `name` varchar(255) NOT NULL default '',
+  `seq_region_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `analysis_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `regulatory_factor_id` int(11) default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`regulatory_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`analysis_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `seq_region_idx_2` (`seq_region_id`,`seq_region_start`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..251b6ba780717ef69823314f6cb192269128d824
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature.txt
@@ -0,0 +1,44 @@
+1	ENST00000310998:hsa-miR-23b	469271	919788	919807	1	1500	1
+2	ENST00000310998:hsa-miR-23a	469271	919787	919807	1	1500	2
+3	ENST00000310998:hsa-miR-224	469271	919793	919810	1	1500	3
+4	ENST00000310998:hsa-miR-138	469271	920016	920035	1	1500	4
+5	ENST00000310998:hsa-miR-133b	469271	919688	919703	1	1500	5
+6	ENST00000310998:hsa-miR-133a	469271	919682	919703	1	1500	6
+7	ENST00000310998:gga-miR-133c	469271	919682	919703	1	1500	7
+8	ENST00000310998:hsa-miR-200a	469271	919775	919790	-1	1500	8
+9	ENST00000278995:hsa-miR-27b	469271	940934	940953	1	1500	9
+10	ENST00000278995:hsa-miR-139	469271	940935	940953	1	1500	10
+11	ENST00000278995:gga-miR-124b	469271	940656	940681	1	1500	11
+12	ENST00000278995:hsa-miR-124a	469271	940656	940681	1	1500	12
+13	ENST00000217299:rno-miR-347	469271	950917	950934	1	1500	13
+14	ENST00000217299:hsa-miR-337	469271	951609	951631	1	1500	14
+15	ENST00000217299:hsa-miR-328	469271	950399	950425	1	1500	15
+16	ENST00000217299:hsa-miR-328	469271	950377	950395	1	1500	15
+17	ENST00000217299:hsa-miR-296	469271	950915	950936	1	1500	16
+18	ENST00000217299:hsa-miR-29a	469271	950657	950677	1	1500	17
+19	ENST00000217299:hsa-miR-29b	469271	950655	950677	1	1500	18
+20	ENST00000217299:hsa-miR-29c	469271	950658	950677	1	1500	19
+21	ENST00000217299:hsa-miR-214	469271	951165	951183	1	1500	20
+22	ENST00000217299:hsa-miR-195	469271	951167	951185	1	1500	21
+23	ENST00000217299:hsa-miR-16	469271	951167	951185	1	1500	22
+24	ENST00000217299:hsa-miR-146	469271	950025	950047	1	1500	23
+25	ENST00000217299:hsa-miR-107	469271	950657	950678	1	1500	24
+26	ENST00000217299:hsa-miR-103	469271	950658	950678	1	1500	25
+27	ENST00000300415:rno-miR-343	469271	973998	974017	-1	1500	26
+28	ENST00000300415:hsa-miR-326	469271	974392	974410	-1	1500	27
+29	ENST00000300415:hsa-miR-145	469271	973967	973995	-1	1500	28
+30	ENST00000262651:rno-miR-347	469271	1030431	1030449	1	1500	13
+31	ENST00000262651:rno-miR-347	469271	1030366	1030385	1	1500	13
+32	ENST00000262651:hsa-miR-296	469271	1030633	1030660	1	1500	16
+33	ENST00000262651:hsa-miR-27a	469271	1030746	1030762	1	1500	29
+34	ENST00000262651:hsa-miR-27b	469271	1030746	1030762	1	1500	9
+35	ENST00000262651:hsa-miR-224	469271	1030746	1030765	1	1500	3
+36	ENST00000262651:hsa-miR-152	469271	1030514	1030543	1	1500	30
+37	ENST00000262651:hsa-miR-148b	469271	1030516	1030543	1	1500	31
+38	ENST00000262651:hsa-miR-148a	469271	1030516	1030543	1	1500	32
+39	ENST00000262651:hsa-miR-144	469271	1030743	1030761	1	1500	33
+40	ENST00000262651:hsa-miR-138	469271	1031432	1031447	1	1500	4
+41	ENST00000262651:hsa-miR-138	469271	1030809	1030823	1	1500	4
+42	ENST00000262651:hsa-miR-130a	469271	1030527	1030543	1	1500	34
+43	ENST00000262651:hsa-miR-130b	469271	1030527	1030543	1	1500	35
+44	ENST00000262651:hsa-let-7i	469271	1031090	1031111	1	1500	36
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature_object.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature_object.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..55b7095d02d5de594e1cbe07499c80b3ffe30c85
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature_object.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `regulatory_feature_object` (
+  `regulatory_feature_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `ensembl_object_type` enum('Transcript','Translation','Gene') NOT NULL default 'Transcript',
+  `ensembl_object_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `influence` enum('positive','negative','mixed','unknown') default NULL,
+  `evidence` varchar(255) default NULL,
+  KEY `regulatory_feature_idx` (`regulatory_feature_id`),
+  KEY `ensembl_object_idx` (`ensembl_object_type`,`ensembl_object_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature_object.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature_object.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..73fab2b37f9784bf61f3ebdf52630053fdb55e99
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_feature_object.txt
@@ -0,0 +1,47 @@
+1	Transcript	21716	negative	
+2	Transcript	21716	negative	
+3	Transcript	21716	negative	
+4	Transcript	21716	negative	
+5	Transcript	21716	negative	
+6	Transcript	21716	negative	
+7	Transcript	21716	negative	
+8	Transcript	21716	negative	
+9	Transcript	21717	negative	
+10	Transcript	21717	negative	
+11	Transcript	21717	negative	
+12	Transcript	21717	negative	
+13	Transcript	21720	negative	
+14	Transcript	21720	negative	
+15	Transcript	21720	negative	
+16	Transcript	21720	negative	
+17	Transcript	21720	negative	
+18	Transcript	21720	negative	
+19	Transcript	21720	negative	
+20	Transcript	21720	negative	
+21	Transcript	21720	negative	
+22	Transcript	21720	negative	
+23	Transcript	21720	negative	
+24	Transcript	21720	negative	
+25	Transcript	21720	negative	
+26	Transcript	21720	negative	
+27	Transcript	21721	negative	
+28	Transcript	21721	negative	
+29	Transcript	21721	negative	
+30	Transcript	21723	negative	
+31	Transcript	21723	negative	
+32	Transcript	21723	negative	
+33	Transcript	21723	negative	
+34	Transcript	21723	negative	
+35	Transcript	21723	negative	
+36	Transcript	21723	negative	
+37	Transcript	21723	negative	
+38	Transcript	21723	negative	
+39	Transcript	21723	negative	
+40	Transcript	21723	negative	
+41	Transcript	21723	negative	
+42	Transcript	21723	negative	
+43	Transcript	21723	negative	
+44	Transcript	21723	negative	
+40	Gene	18257	positive	\N
+41	Gene	18258	positive	\N
+42	Gene	18259	positive	\N
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_search_region.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_search_region.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..ca9988be1645e6a3dfe3bdbcac64bdaa53cb3e90
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_search_region.sql
@@ -0,0 +1,17 @@
+CREATE TABLE `regulatory_search_region` (
+  `regulatory_search_region_id` int(11) NOT NULL auto_increment,
+  `name` varchar(255) NOT NULL default '',
+  `seq_region_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(11) NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(4) NOT NULL default '0',
+  `ensembl_object_type` enum('Transcript','Translation','Gene') NOT NULL default 'Transcript',
+  `ensembl_object_id` int(11) default NULL,
+  `analysis_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`regulatory_search_region_id`),
+  KEY `rsr_idx` (`regulatory_search_region_id`),
+  KEY `ensembl_object_idx` (`ensembl_object_type`,`ensembl_object_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `seq_region_idx_2` (`seq_region_id`,`seq_region_start`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_search_region.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_search_region.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..bc58c2f274d592ffa0d8358edb4441e410f634cf
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/regulatory_search_region.txt
@@ -0,0 +1,10 @@
+1	CisRed_Search_2	469293	99697840	99699489	-1	Gene	18256	5011
+2	CisRed_Search_11	469293	99639860	99646074	1	Gene	18256	5011
+3	CisRed_Search_18	469293	166594596	166599297	-1	Gene	18257	5011
+4	CisRed_Search_27	469293	166493136	166495988	1	Gene	18258	5011
+5	CisRed_Search_34	469293	193348613	193352931	1	Gene	18256	5011
+6	CisRed_Search_39	469293	53517691	53519509	-1	Gene	18257	5011
+7	CisRed_Search_49	469293	41147153	41148821	1	Gene	18257	5011
+8	CisRed_Search_56	469293	46204112	46205970	1	Gene	18258	5011
+9	CisRed_Search_62	469293	116712317	116714167	1	Gene	18258	5011
+10	CisRed_Search_81	469293	91519966	91521943	-1	Gene	18258	5011
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_consensus.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_consensus.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..6b745f04281e6f22d5d0ce9f6d794f1b61d98a6a
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_consensus.sql
@@ -0,0 +1,13 @@
+CREATE TABLE `repeat_consensus` (
+  `repeat_consensus_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `repeat_name` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `repeat_class` varchar(100) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `repeat_type` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `repeat_consensus` text collate latin1_bin,
+  PRIMARY KEY  (`repeat_consensus_id`),
+  KEY `name` (`repeat_name`),
+  KEY `class` (`repeat_class`),
+  KEY `consensus` (`repeat_consensus`(10)),
+  KEY `type` (`repeat_type`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_consensus.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_consensus.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..40c3a84dffd1fae8f6d91fb852f444a4b14db5e7
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_consensus.txt
@@ -0,0 +1,155 @@
+1	MIR	Type I Transposons/SINE	ALU	
+2	L2	Type I Transposons/LINE		
+3	AluSx	Type I Transposons/SINE	ALU	
+4	AluJo	Type I Transposons/SINE	ALU	
+5	AluY	Type I Transposons/SINE	ALU	
+6	AluJb	Type I Transposons/SINE	ALU	
+7	AluSq	Type I Transposons/SINE	ALU	
+8	AluSg	Type I Transposons/SINE	ALU	
+9	MIR3	Type I Transposons/SINE	ALU	
+10	AluSp	Type I Transposons/SINE	ALU	
+11	L1M4	Type I Transposons/LINE		
+12	MER5A	Type II Transposons		
+14	AluSc	Type I Transposons/SINE	ALU	
+15	L3	Type I Transposons/LINE		
+16	L1ME	Type I Transposons/LINE		
+17	FLAM_C	Type I Transposons/SINE	ALU	
+18	L1ME1	Type I Transposons/LINE		
+19	L1ME4a	Type I Transposons/LINE		
+20	MLT1A	LTRs	LTR	
+21	L1ME3A	Type I Transposons/LINE		
+22	AluSg/x	Type I Transposons/SINE	ALU	
+23	HAL1	Type I Transposons/LINE		
+24	L1MEc	Type I Transposons/LINE		
+25	L1MC4	Type I Transposons/LINE		
+26	MER5B	Type II Transposons		
+27	L1MC4a	Type I Transposons/LINE		
+28	L1MB7	Type I Transposons/LINE		
+30	THE1C	LTRs	LTR	
+31	L1	Type I Transposons/LINE		
+32	FRAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+33	MLT1D	LTRs	LTR	
+34	L1ME2	Type I Transposons/LINE		
+35	L1MC5	Type I Transposons/LINE		
+38	FLAM_A	Type I Transposons/SINE	ALU	
+39	MLT1B	LTRs	LTR	
+40	L1MB3	Type I Transposons/LINE		
+41	L1MB8	Type I Transposons/LINE		
+42	MER20	Type II Transposons		
+43	MLT1K	LTRs	LTR	
+44	L1MC/D	Type I Transposons/LINE		
+45	L1MA9	Type I Transposons/LINE		
+46	MLT1J	LTRs	LTR	
+47	L1MC3	Type I Transposons/LINE		
+48	L1MEd	Type I Transposons/LINE		
+49	L1MC1	Type I Transposons/LINE		
+53	L1MD2	Type I Transposons/LINE		
+54	MER58A	Type II Transposons		
+55	Tigger1	Type II Transposons		
+59	L1P	Type I Transposons/LINE		
+60	MLT1H	LTRs	LTR	
+61	MLT1I	LTRs	LTR	
+62	L1ME3	Type I Transposons/LINE		
+63	L1PA5	Type I Transposons/LINE		
+64	MER3	Type II Transposons		
+65	L1MA8	Type I Transposons/LINE		
+66	MLT1L	LTRs	LTR	
+67	L1PA3	Type I Transposons/LINE		
+70	L1MA4	Type I Transposons/LINE		
+71	L1MCa	Type I Transposons/LINE		
+73	L1MB5	Type I Transposons/LINE		
+74	L1MB2	Type I Transposons/LINE		
+77	MER21B	LTRs	LTR	
+78	LTR16C	LTRs	LTR	
+79	MSTB	LTRs	LTR	
+82	MER2	Type II Transposons		
+83	L1MB4	Type I Transposons/LINE		
+84	L1MD3	Type I Transposons/LINE		
+85	MER33	Type II Transposons		
+86	L1PB4	Type I Transposons/LINE		
+87	MADE1	Type II Transposons		
+88	L1PA8	Type I Transposons/LINE		
+89	AluSq/x	Type I Transposons/SINE	ALU	
+90	MLT1J2	LTRs	LTR	
+91	L3b	Type I Transposons/LINE		
+94	Charlie8	Type II Transposons		
+96	L1MD1	Type I Transposons/LINE		
+99	Alu	Type I Transposons/SINE	ALU	
+103	L1MC2	Type I Transposons/LINE		
+105	MLT1F1	LTRs	LTR	
+106	MER103	Type II Transposons		
+107	L1MB1	Type I Transposons/LINE		
+108	AluSg1	Type I Transposons/SINE	ALU	
+111	L1MA4A	Type I Transposons/LINE		
+112	FAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+113	AluYc	Type I Transposons/SINE	ALU	
+114	L1M2	Type I Transposons/LINE		
+117	L1MA10	Type I Transposons/LINE		
+118	MER53	Type II Transposons		
+119	LTR67	LTRs	LTR	
+121	MLT1F	LTRs	LTR	
+122	MLT1E	LTRs	LTR	
+127	MER7A	Type II Transposons		
+128	Charlie1	Type II Transposons		
+129	MSTB1	LTRs	LTR	
+131	Tigger7	Type II Transposons		
+133	MER69	Type II Transposons		
+134	L1PA17	Type I Transposons/LINE		
+135	MLT1G1	LTRs	LTR	
+139	MLT1H1	LTRs	LTR	
+140	MER44D	Type II Transposons		
+143	Tigger3(Golem)	Type II Transposons		
+148	MER113	Type II Transposons		
+149	MLT1E2	LTRs	LTR	
+151	MER30	Type II Transposons		
+152	MER117	Type II Transposons		
+153	MER94	Type II Transposons		
+154	AluJ/FLAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+155	AluYa5	Type I Transposons/SINE	ALU	
+162	Tigger5	Type II Transposons		
+164	AluYb8	Type I Transposons/SINE	ALU	
+168	MLT1G	LTRs	LTR	
+171	SVA	Other repeats		
+172	MER91A	Type II Transposons		
+174	MER5C	Type II Transposons		
+176	Charlie5	Type II Transposons		
+179	MER81	Type II Transposons		
+180	AluS	Type I Transposons/SINE	ALU	
+182	LTR16B	LTRs	LTR	
+188	MER39	LTRs	LTR	
+191	MSTC	LTRs	LTR	
+196	AluSp/q	Type I Transposons/SINE	ALU	
+199	MARNA	Type II Transposons		
+206	MLT2C1	LTRs	LTR	
+208	MER46C	Type II Transposons		
+209	MER41A	LTRs	LTR	
+215	LTR7	LTRs	LTR	
+216	L1P4	Type I Transposons/LINE		
+218	L1P3	Type I Transposons/LINE		
+222	AluJo/FLAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+223	MER47A	Type II Transposons		
+225	MER115	Type II Transposons		
+230	Charlie4a	Type II Transposons		
+234	MER102b	Type II Transposons		
+238	Zaphod	Type II Transposons		
+240	MER46B	Type II Transposons		
+252	AluJ/FRAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+253	AluJo/FRAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+256	MER68	LTRs	LTR	
+258	MER21A	LTRs	LTR	
+281	LTR30	LTRs	LTR	
+283	MER65A	LTRs	LTR	
+285	MER66B	LTRs	LTR	
+288	MER102a	Type II Transposons		
+305	5S	RNA repeats		
+320	LTR48B	LTRs	LTR	
+332	FLAM	Type I Transposons/SINE	ALU	
+374	MLT1G3	LTRs	LTR	
+445	MER7D	Type II Transposons		
+560	LTR19B	LTRs	LTR	
+579	MER30B	Type II Transposons		
+632	MER65B	LTRs	LTR	
+637	U1	RNA repeats		
+685	MER21A-int	LTRs	LTR	
+890	tRNA-Asp-GAY	RNA repeats		
+1017	tRNA-Val-GTA	RNA repeats		
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_feature.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_feature.sql
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index 0000000000000000000000000000000000000000..aeef649e64226820c62eac43fdbb029b6b8f2f85
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_feature.sql
@@ -0,0 +1,17 @@
+CREATE TABLE `repeat_feature` (
+  `repeat_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(1) NOT NULL default '1',
+  `repeat_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `repeat_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `repeat_consensus_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `score` double default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`repeat_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `repeat_idx` (`repeat_consensus_id`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=100000000 AVG_ROW_LENGTH=80;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..ae5a139bb308e794c9503d3ae96a259880168d25
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/repeat_feature.txt
@@ -0,0 +1,2356 @@
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--- /dev/null
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+CREATE TABLE `seq_region` (
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `name` varchar(40) NOT NULL default '',
+  `coord_system_id` int(10) NOT NULL default '0',
+  `length` int(10) NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`seq_region_id`),
+  UNIQUE KEY `coord_system_id` (`coord_system_id`,`name`),
+  KEY `name_idx` (`name`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
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--- /dev/null
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,8 @@
+CREATE TABLE `seq_region_attrib` (
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `attrib_type_id` smallint(5) unsigned NOT NULL default '0',
+  `value` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  KEY `type_val_idx` (`attrib_type_id`,`value`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/seq_region_attrib.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/seq_region_attrib.txt
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index 0000000000000000000000000000000000000000..58dd00b5e807e256a5ab15c64c665c2fcfe25d67
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/seq_region_attrib.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/simple_feature.sql
@@ -0,0 +1,15 @@
+CREATE TABLE `simple_feature` (
+  `simple_feature_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `seq_region_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_start` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_end` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_region_strand` tinyint(1) NOT NULL default '0',
+  `display_label` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `analysis_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `score` double default NULL,
+  PRIMARY KEY  (`simple_feature_id`),
+  KEY `seq_region_idx` (`seq_region_id`,`seq_region_start`),
+  KEY `analysis_idx` (`analysis_id`),
+  KEY `hit_idx` (`display_label`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=100000000 AVG_ROW_LENGTH=80;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/simple_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/simple_feature.txt
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/simple_feature.txt
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--- /dev/null
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+CREATE TABLE `stable_id_event` (
+  `old_stable_id` varchar(128) collate latin1_bin default NULL,
+  `old_version` smallint(6) default NULL,
+  `new_stable_id` varchar(128) collate latin1_bin default NULL,
+  `new_version` smallint(6) default NULL,
+  `mapping_session_id` int(10) NOT NULL default '0',
+  `type` enum('gene','transcript','translation') collate latin1_bin NOT NULL default 'gene',
+  `score` FLOAT NOT NULL DEFAULT 0,
+  UNIQUE KEY `uni_idx` (`mapping_session_id`,`old_stable_id`,`old_version`,`new_stable_id`,`new_version`,`type`),
+  KEY `new_idx` (`new_stable_id`),
+  KEY `old_idx` (`old_stable_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
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--- /dev/null
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+\N	\N	T8	1	2	transcript	1
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+\N	\N	T7	1	3	transcript	1
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,8 @@
+CREATE TABLE `supporting_feature` (
+  `exon_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `feature_type` enum('dna_align_feature','protein_align_feature') collate latin1_bin default NULL,
+  `feature_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  UNIQUE KEY `all_idx` (`exon_id`,`feature_type`,`feature_id`),
+  KEY `feature_idx` (`feature_type`,`feature_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=100000000 AVG_ROW_LENGTH=80;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/supporting_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/supporting_feature.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..a4f735219eae5091f3411c02b94ef0793d6aa646
--- /dev/null
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+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
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+  KEY `type_val_idx` (`attrib_type_id`,`value`),
+  KEY `transcript_idx` (`transcript_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
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+CREATE TABLE `transcript_stable_id` (
+  `transcript_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `stable_id` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `version` int(10) default NULL,
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+  PRIMARY KEY  (`transcript_id`),
+  KEY `stable_id` (`stable_id`,`version`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/transcript_stable_id.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/transcript_stable_id.txt
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--- /dev/null
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@@ -0,0 +1,25 @@
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--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/transcript_supporting_feature.sql
@@ -0,0 +1,8 @@
+CREATE TABLE `transcript_supporting_feature` (
+  `transcript_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `feature_type` enum('dna_align_feature','protein_align_feature') collate latin1_bin default NULL,
+  `feature_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  UNIQUE KEY `all_idx` (`transcript_id`,`feature_type`,`feature_id`),
+  KEY `feature_idx` (`feature_type`,`feature_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin MAX_ROWS=100000000 AVG_ROW_LENGTH=80;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/transcript_supporting_feature.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/transcript_supporting_feature.txt
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..744d18f34d25d771c77bbf04b493029f335ce3df
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation.sql
@@ -0,0 +1,11 @@
+CREATE TABLE `translation` (
+  `translation_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `transcript_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_start` int(10) NOT NULL default '0',
+  `start_exon_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `seq_end` int(10) NOT NULL default '0',
+  `end_exon_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  PRIMARY KEY  (`translation_id`),
+  KEY `transcript_id` (`transcript_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..c99c09816c7278e5a4431fff6e14c99d5dcfce7a
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation.txt
@@ -0,0 +1,25 @@
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index 0000000000000000000000000000000000000000..2500090617ede1621eb45ef229b898a3aa5dd809
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_attrib.sql
@@ -0,0 +1,8 @@
+CREATE TABLE `translation_attrib` (
+  `translation_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `attrib_type_id` smallint(5) unsigned NOT NULL default '0',
+  `value` varchar(255) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  KEY `type_val_idx` (`attrib_type_id`,`value`),
+  KEY `translation_idx` (`translation_id`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_attrib.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_attrib.txt
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_stable_id.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_stable_id.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..03e66aadbc930a2595470a4dd4beea96b3c8f835
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_stable_id.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `translation_stable_id` (
+  `translation_id` int(10) unsigned NOT NULL default '0',
+  `stable_id` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `version` int(10) default NULL,
+  `created_date` datetime NOT NULL default '0000-00-00 00:00:00',
+  `modified_date` datetime NOT NULL default '0000-00-00 00:00:00',
+  PRIMARY KEY  (`translation_id`),
+  UNIQUE KEY `stable_id` (`stable_id`,`version`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_stable_id.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_stable_id.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..51a84918367370436b2d8565ff67b380da3af1a4
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/translation_stable_id.txt
@@ -0,0 +1,25 @@
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+21721	ENSP00000300415	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+21722	ENSP00000262659	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+21723	ENSP00000262651	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+21724	ENSP00000217315	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+21725	ENSP00000246203	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
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+21728	ENSP00000217326	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
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+21734	ENSP00000201961	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+21735	ENSP00000310454	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
+21736	ENSP00000278980	1	2004-12-06 12:00:00	2004-12-06 12:00:00
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diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unconventional_transcript_association.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unconventional_transcript_association.sql
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index 0000000000000000000000000000000000000000..0815030960f228e48e017b0688e7816a1fe847e0
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unconventional_transcript_association.sql
@@ -0,0 +1,10 @@
+CREATE TABLE `unconventional_transcript_association` (
+
+       `transcript_id`    INT(10) UNSIGNED NOT NULL,
+       `gene_id`          INT(10) UNSIGNED NOT NULL,
+       `interaction_type` ENUM("antisense","sense_intronic","sense_overlaping_exonic","chimeric_sense_exonic"),
+
+       KEY (transcript_id),
+       KEY (gene_id)
+
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unconventional_transcript_association.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unconventional_transcript_association.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..31d0920db4b0c85b064d5f297773b05ce9d8485c
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unconventional_transcript_association.txt
@@ -0,0 +1,5 @@
+21716	18256	antisense
+21717	18256	antisense
+21719	18256	sense_intronic
+21718	18257	sense_intronic
+21718	18258	antisense
\ No newline at end of file
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unmapped_object.sql b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unmapped_object.sql
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..cb273afdc0b571c0064f68e5792dad6cc6eb2155
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unmapped_object.sql
@@ -0,0 +1,18 @@
+CREATE TABLE `unmapped_object` (
+
+  `unmapped_object_id`    INT UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT,
+  `type`                  ENUM("xref", "cDNA", "Marker"),
+  `analysis_id`           INT(10) UNSIGNED NOT NULL,
+  `external_db_id`        INT,
+  `identifier`            VARCHAR(255) NOT NULL,
+  `unmapped_reason_id`    SMALLINT(5) UNSIGNED NOT NULL,
+  `query_score`           DOUBLE,
+  `target_score`          DOUBLE, 
+  `ensembl_id`            INT(10) unsigned default '0',
+  `ensembl_object_type`   ENUM('RawContig','Transcript','Gene','Translation') collate latin1_bin default 'RawContig',
+  PRIMARY KEY            (`unmapped_object_id`),
+  KEY                    id_idx(`identifier`),
+  KEY                    anal_idx(`analysis_id`),
+  KEY                    anal_exdb_idx(`analysis_id`,`external_db_id`)
+   
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
\ No newline at end of file
diff --git a/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unmapped_object.txt b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unmapped_object.txt
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..0283a2b2793263c21c8e7433783be7aa3c420e28
--- /dev/null
+++ b/modules/t/test-genome-DBs/homo_sapiens/core/unmapped_object.txt
@@ -0,0 +1,4 @@
+1	xref	9	4100	X1234	1	70.5	60.2	21716	Translation
+2	xref	9	4100	X5678	1	75.0	50.1	21717	Transcript
+3	cDNA	1290	4200	cDNA12	2	80.0	40.0	21718	Translation
+4	cDNA	1290	4200	cDNA34	2	60.5	30.9	21719	Transcript
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+
+  `unmapped_reason_id`    SMALLINT(5) UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT,
+  `summary_description`   VARCHAR(255),
+  `full_description`      VARCHAR(255),
+
+  PRIMARY KEY (`unmapped_reason_id`)
+
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
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+1	exonerate failed to match in xref system	exonerate match was below the thresholds of 90%
+2	failed to map	 failed to map the cDNA viw exonerate using the cutoff of 95%
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+CREATE TABLE `xref` (
+  `xref_id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
+  `external_db_id` int(11) NOT NULL default '0',
+  `dbprimary_acc` varchar(40) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `display_label` varchar(128) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `version` varchar(10) collate latin1_bin NOT NULL default '',
+  `description` varchar(255) collate latin1_bin default NULL,
+  `info_type` ENUM('PROJECTION', 'MISC','DEPENDENT','DIRECT','SEQUENCE_MATCH','INFERRED_PAIR','PROBE','UNMAPPED'),
+  `info_text` VARCHAR(255),
+  `priority` INT,
+
+  PRIMARY KEY  (`xref_id`),
+  UNIQUE KEY `id_index` (`dbprimary_acc`,`external_db_id`),
+  KEY `display_index` (`display_label`)
+) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 COLLATE=latin1_bin;
+
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